More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5268 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 333 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  95.2 
 
 		 348 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  78.01 
 
 		 338 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  78.01 
 
 		 337 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  76.28 
 
 		 333 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  76.28 
 
 		 333 aa  521  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  75.38 
 
 		 334 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  74.17 
 
 		 339 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.47 
 
 		 333 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  70.87 
 
 		 339 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  50.75 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  50.45 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  50.75 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.75 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  52.55 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.15 
 
 		 332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  50.15 
 
 		 332 aa  325  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.45 
 
 		 332 aa  325  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  50.45 
 
 		 332 aa  325  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  50.45 
 
 		 332 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.16 
 
 		 333 aa  325  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.35 
 
 		 333 aa  323  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.25 
 
 		 333 aa  322  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.25 
 
 		 332 aa  322  7e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.15 
 
 		 332 aa  322  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.6 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.15 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.65 
 
 		 333 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.9 
 
 		 334 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.45 
 
 		 333 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 		 333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.85 
 
 		 333 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.75 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  46.39 
 
 		 331 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  50.75 
 
 		 333 aa  302  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  48.05 
 
 		 334 aa  301  7.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 		 333 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37060  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  44.88 
 
 		 331 aa  251  9.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.42 
 
 		 317 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  40.42 
 
 		 317 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 		 308 aa  241  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  39.82 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.52 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.4 
 
 		 287 aa  229  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2686  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.83 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  36.12 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  36.14 
 
 		 308 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 		 313 aa  212  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.74 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18400  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  37.43 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.18114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.84 
 
 		 639 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  35.84 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.44 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 312 aa  196  7e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  34.23 
 
 		 323 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  34.83 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.14 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.65 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.74 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 		 307 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.91 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 		 326 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1504  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  36.05 
 
 		 358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.24 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.82 
 
 		 331 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  33.24 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  33.24 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.57 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.08 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.94 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.56 
 
 		 335 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 335 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.56 
 
 		 313 aa  178  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.72 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.17 
 
 		 339 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.22 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 		 335 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.15 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.62 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.76 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  33.14 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.4 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.78 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  35.21 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  35.52 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>