More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2008 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
333 aa  669    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.17 
 
 
332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.27 
 
 
333 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.59 
 
 
333 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.17 
 
 
333 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.47 
 
 
333 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  64.86 
 
 
333 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  63.58 
 
 
333 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  63.06 
 
 
334 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.37 
 
 
333 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.16 
 
 
333 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.06 
 
 
333 aa  415  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.25 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  66.37 
 
 
333 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  62.99 
 
 
333 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  54.05 
 
 
333 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  74.49 
 
 
287 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  51.51 
 
 
331 aa  348  7e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  48.05 
 
 
332 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37060  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  55.72 
 
 
331 aa  332  6e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.85 
 
 
334 aa  332  8e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  48.05 
 
 
332 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  48.05 
 
 
332 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.51 
 
 
338 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.05 
 
 
332 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  48.05 
 
 
332 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.45 
 
 
332 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  47.75 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  50.9 
 
 
337 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.85 
 
 
332 aa  325  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.45 
 
 
332 aa  325  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  48.35 
 
 
339 aa  323  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.05 
 
 
333 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  49.55 
 
 
333 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  51.05 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  47.75 
 
 
339 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 
348 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.28 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  44.28 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  43.37 
 
 
317 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.07 
 
 
317 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  40.3 
 
 
308 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  41.57 
 
 
333 aa  252  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  40.3 
 
 
308 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  42.34 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  41.12 
 
 
312 aa  237  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2686  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.64 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18400  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  40.3 
 
 
333 aa  231  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.18114  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.65 
 
 
639 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.06 
 
 
320 aa  225  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.48 
 
 
317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.05 
 
 
314 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  41.57 
 
 
323 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.06 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  39.07 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 
328 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.82 
 
 
313 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  38.21 
 
 
358 aa  208  9e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  41.92 
 
 
317 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  35.84 
 
 
304 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  36.34 
 
 
305 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.76 
 
 
323 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.94 
 
 
310 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.24 
 
 
314 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  35.15 
 
 
308 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.32 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.24 
 
 
330 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 
322 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.12 
 
 
328 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 
321 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.96 
 
 
323 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
335 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.94 
 
 
310 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.83 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.55 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.8 
 
 
326 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.5 
 
 
317 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.35 
 
 
313 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
327 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3545  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.75 
 
 
339 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.98 
 
 
314 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
327 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  35.57 
 
 
325 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.65 
 
 
335 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 
335 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.39 
 
 
327 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
318 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2916  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.13 
 
 
333 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  35.78 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  35.48 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.56 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1997  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.75 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.01 
 
 
308 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1998  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.15 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>