More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6444 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
333 aa  658    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.77 
 
 
333 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.57 
 
 
333 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.37 
 
 
333 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.57 
 
 
333 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  64.2 
 
 
333 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.36 
 
 
334 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.16 
 
 
333 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  62.46 
 
 
334 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.96 
 
 
333 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  64.86 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.86 
 
 
332 aa  411  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  55.86 
 
 
333 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.56 
 
 
333 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  60.49 
 
 
333 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  60.66 
 
 
333 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  51.65 
 
 
332 aa  371  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.65 
 
 
332 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  51.65 
 
 
332 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  51.95 
 
 
332 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.35 
 
 
332 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.65 
 
 
332 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.65 
 
 
332 aa  368  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  51.35 
 
 
332 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  51.05 
 
 
332 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37060  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  56.02 
 
 
331 aa  351  8.999999999999999e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  52.11 
 
 
331 aa  348  9e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  48.05 
 
 
339 aa  328  7e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  48.65 
 
 
333 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  48.65 
 
 
333 aa  319  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.75 
 
 
334 aa  318  7e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.7 
 
 
338 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.73 
 
 
287 aa  315  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  49.1 
 
 
337 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.05 
 
 
333 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 
339 aa  309  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  46.85 
 
 
348 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.28 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  44.28 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  43.67 
 
 
317 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.07 
 
 
317 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  41.19 
 
 
308 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  42.69 
 
 
308 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 
313 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
333 aa  252  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2686  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.04 
 
 
333 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
333 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18400  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  42.51 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.18114  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  40.24 
 
 
323 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  38.48 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.84 
 
 
310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  40.3 
 
 
321 aa  215  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
312 aa  212  7.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  39.04 
 
 
304 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  39.59 
 
 
322 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  42.17 
 
 
317 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.58 
 
 
320 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  36.28 
 
 
305 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.45 
 
 
314 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.34 
 
 
314 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  38.37 
 
 
312 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.76 
 
 
317 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  39 
 
 
326 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.54 
 
 
307 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.93 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1050  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  38.42 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
307 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.17 
 
 
331 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  36.42 
 
 
358 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.97 
 
 
323 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 
328 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.94 
 
 
328 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.24 
 
 
310 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.55 
 
 
307 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  35.17 
 
 
331 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  34.88 
 
 
331 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.17 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.72 
 
 
639 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.2 
 
 
335 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
335 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.59 
 
 
331 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.08 
 
 
338 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
325 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.01 
 
 
314 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.13 
 
 
308 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.68 
 
 
330 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.12 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.67 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.48 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.75 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
318 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4198  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
323 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00226105  normal  0.135586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  35.39 
 
 
339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1998  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.06 
 
 
318 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.84 
 
 
339 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.61 
 
 
308 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>