More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2379 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
338 aa  690    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  72.84 
 
 
339 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  67.76 
 
 
339 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  64.97 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.16 
 
 
334 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5695  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.6 
 
 
343 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.97 
 
 
334 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  37.76 
 
 
308 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
312 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.64 
 
 
308 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.76 
 
 
320 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.39 
 
 
326 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.07 
 
 
323 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 
325 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.62 
 
 
313 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.03 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.08 
 
 
333 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.24 
 
 
333 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.71 
 
 
314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.06 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.58 
 
 
314 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
308 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  39.82 
 
 
313 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.48 
 
 
639 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
331 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
321 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  35.31 
 
 
312 aa  179  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.12 
 
 
319 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
333 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.76 
 
 
314 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.28 
 
 
311 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.46 
 
 
329 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  32.33 
 
 
304 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.21 
 
 
317 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.14 
 
 
310 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1050  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
320 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.23 
 
 
317 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 
317 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
337 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  33.13 
 
 
305 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
333 aa  175  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  36.25 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.36 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2330  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.93 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700885  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  33.63 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.33 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.77 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.62 
 
 
334 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.49 
 
 
333 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.64 
 
 
310 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
333 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.84 
 
 
333 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
322 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
328 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.3 
 
 
334 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 
333 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.64 
 
 
332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
339 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 
333 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
326 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  32.39 
 
 
333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  36.86 
 
 
317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.68 
 
 
332 aa  165  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
333 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.59 
 
 
332 aa  165  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.79 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 
339 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.58 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.03 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.07 
 
 
332 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  32.54 
 
 
308 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.23 
 
 
332 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
333 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.23 
 
 
332 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.51 
 
 
332 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
332 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
317 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.84 
 
 
333 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
308 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
326 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.84 
 
 
322 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3826  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.25 
 
 
311 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.0906959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.28 
 
 
328 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
333 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  35.42 
 
 
307 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.22 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35 
 
 
317 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 
327 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.77 
 
 
334 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
333 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.39 
 
 
308 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  35.21 
 
 
318 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.92 
 
 
330 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.77 
 
 
334 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>