More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0078 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  100 
 
 		 317 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  82.64 
 
 		 323 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  65.15 
 
 		 321 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  45.78 
 
 		 308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  44.73 
 
 		 312 aa  252  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.55 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  46.67 
 
 		 326 aa  238  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  43.18 
 
 		 304 aa  238  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.18 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.79 
 
 		 307 aa  232  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  44.66 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 		 308 aa  228  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.2 
 
 		 319 aa  228  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.77 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.17 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  40.39 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.01 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.92 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  40.45 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.02 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5628  alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.13 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.51 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.64 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.64 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.64 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.66 
 
 		 333 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.64 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.64 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.34 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.04 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.7 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  40 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.6 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  41.51 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  44.41 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4293  NADPH:quinone reductase  44.16 
 
 		 308 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213277  normal  0.0250565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  36.98 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.99 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.44 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  38.86 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.04 
 
 		 332 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  41.08 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.24 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.34 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.62 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.52 
 
 		 339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.03 
 
 		 328 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.99 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  38.25 
 
 		 333 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  37.7 
 
 		 317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  41.12 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.7 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.39 
 
 		 330 aa  195  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 		 320 aa  195  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 		 333 aa  195  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.53 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.5 
 
 		 337 aa  193  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37060  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  41.62 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.53 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.36 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  36.23 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1050  alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  37.91 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  37.39 
 
 		 358 aa  188  9e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  35.37 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.46 
 
 		 639 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.82 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  35.06 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.35 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5695  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.79 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.18 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.64 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.79 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.76 
 
 		 331 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.06 
 
 		 331 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.04 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.09 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.89 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.76 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.09 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2213  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.22 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>