More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2644 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
329 aa  670    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  74.92 
 
 
323 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.28 
 
 
314 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 
325 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  38.75 
 
 
308 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  38.2 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.74 
 
 
319 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.93 
 
 
320 aa  215  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  40.18 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  41.23 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.43 
 
 
326 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  38.82 
 
 
308 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.12 
 
 
315 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  40.57 
 
 
313 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 
312 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  38.87 
 
 
304 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.19 
 
 
310 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.11 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  39.51 
 
 
317 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.6 
 
 
639 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.74 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.41 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.4 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.31 
 
 
313 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  35.89 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.14 
 
 
317 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
313 aa  192  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.56 
 
 
314 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
321 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.96 
 
 
313 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.2 
 
 
308 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  36.28 
 
 
312 aa  188  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.66 
 
 
332 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
328 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  36.88 
 
 
305 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.66 
 
 
332 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.36 
 
 
332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.36 
 
 
332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  34.68 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.07 
 
 
332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.58 
 
 
310 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.15 
 
 
333 aa  182  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37 
 
 
317 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
333 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.46 
 
 
338 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
339 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
326 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.18 
 
 
332 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.72 
 
 
339 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.47 
 
 
332 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1050  alcohol dehydrogenase  37.62 
 
 
320 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.45 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4198  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00226105  normal  0.135586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  38.66 
 
 
331 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1020  quinone oxidoreductase  35.58 
 
 
315 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.740068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
307 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.65 
 
 
333 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4637  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.46 
 
 
309 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5628  alcohol dehydrogenase  38.01 
 
 
308 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
329 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 
322 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5695  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.72 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.1 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
317 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.66 
 
 
334 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.31 
 
 
317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.46 
 
 
333 aa  165  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.01 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.34 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.7 
 
 
333 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.84 
 
 
318 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.92 
 
 
332 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.86 
 
 
333 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
337 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2213  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
310 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.84 
 
 
334 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.77 
 
 
334 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.44 
 
 
307 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.27 
 
 
338 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
333 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
333 aa  159  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2330  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.38 
 
 
314 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700885  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.03 
 
 
322 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 
333 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  35.37 
 
 
307 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
307 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.22 
 
 
323 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  30.09 
 
 
333 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.15 
 
 
333 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.95 
 
 
337 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 
333 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.84 
 
 
334 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>