More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37060  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  100 
 
 
331 aa  652    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.94 
 
 
334 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.73 
 
 
333 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.02 
 
 
333 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.93 
 
 
333 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.43 
 
 
333 aa  362  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.7 
 
 
333 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 
333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  57.83 
 
 
333 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  53.01 
 
 
334 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.41 
 
 
333 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.73 
 
 
333 aa  349  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  50.9 
 
 
333 aa  349  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.72 
 
 
333 aa  348  6e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.87 
 
 
332 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 
333 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  56.93 
 
 
333 aa  332  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.02 
 
 
332 aa  311  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.71 
 
 
332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.02 
 
 
332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 
332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.71 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.71 
 
 
332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.41 
 
 
332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.71 
 
 
332 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.71 
 
 
332 aa  298  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.69 
 
 
287 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  46.25 
 
 
331 aa  296  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
339 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.74 
 
 
334 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  47.29 
 
 
333 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  44.58 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.39 
 
 
338 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  45.18 
 
 
337 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  44.88 
 
 
333 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
333 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  43.84 
 
 
333 aa  248  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.79 
 
 
317 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 
317 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  42.81 
 
 
317 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.66 
 
 
333 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.48 
 
 
317 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
308 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  38.62 
 
 
308 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18400  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  37.31 
 
 
333 aa  208  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.18114  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2686  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.81 
 
 
333 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  42.68 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.69 
 
 
639 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  40.61 
 
 
321 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.84 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.34 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.42 
 
 
337 aa  185  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  39.64 
 
 
307 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.39 
 
 
313 aa  185  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  35.24 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.39 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.1 
 
 
326 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.41 
 
 
317 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  40.65 
 
 
314 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  37.34 
 
 
305 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.01 
 
 
308 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  38.24 
 
 
358 aa  181  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  42.37 
 
 
312 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  41.62 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38 
 
 
323 aa  178  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  38.23 
 
 
322 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
312 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  39.27 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.09 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.48 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.01 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.37 
 
 
328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  37.84 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.59 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.15 
 
 
317 aa  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
314 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.98 
 
 
330 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2916  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.42 
 
 
333 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.12 
 
 
314 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.61 
 
 
323 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
328 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.2 
 
 
308 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  34.3 
 
 
331 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.91 
 
 
335 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.78 
 
 
326 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
335 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  34.01 
 
 
331 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.51 
 
 
319 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.01 
 
 
331 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.47 
 
 
317 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1670  alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
328 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000446585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.01 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  35.52 
 
 
304 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>