More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1166 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  95.5 
 
 
333 aa  634    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
333 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.78 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.08 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.08 
 
 
332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.48 
 
 
332 aa  305  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.48 
 
 
332 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.48 
 
 
332 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
332 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.18 
 
 
332 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.48 
 
 
332 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.67 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  44.58 
 
 
333 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  43.67 
 
 
337 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.88 
 
 
333 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
333 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.77 
 
 
338 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.57 
 
 
333 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
331 aa  260  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
333 aa  255  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  43.66 
 
 
358 aa  250  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.64 
 
 
333 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  41.57 
 
 
333 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  42.47 
 
 
333 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 
348 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 
333 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  39.76 
 
 
333 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.34 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.16 
 
 
333 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.06 
 
 
333 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.24 
 
 
334 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  39.46 
 
 
339 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 
333 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37060  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  44.44 
 
 
331 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 
334 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 
333 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.94 
 
 
332 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
308 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18400  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  38.74 
 
 
333 aa  225  7e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.18114  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
339 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  35.61 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.31 
 
 
317 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.61 
 
 
317 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
317 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  37.72 
 
 
308 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  37.65 
 
 
304 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  37.09 
 
 
312 aa  209  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2686  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.83 
 
 
333 aa  208  9e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.06 
 
 
310 aa  203  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.94 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  38.79 
 
 
323 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  35.05 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  35.8 
 
 
305 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.35 
 
 
317 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.35 
 
 
314 aa  193  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.39 
 
 
308 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  35.76 
 
 
321 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  38.35 
 
 
307 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 
327 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
317 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.84 
 
 
314 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
326 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.66 
 
 
336 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  0.659937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  39.47 
 
 
314 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
327 aa  185  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.45 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4348  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.72 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185059 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.33 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.54 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 
326 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.63 
 
 
639 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.29 
 
 
328 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.65 
 
 
324 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
325 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.76 
 
 
307 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.44 
 
 
314 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.01 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  38.25 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.37 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.8 
 
 
330 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
307 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.5 
 
 
322 aa  169  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.41 
 
 
330 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.23 
 
 
310 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5628  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
308 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.92 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
339 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.38 
 
 
335 aa  165  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.36 
 
 
331 aa  165  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.3 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.91 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>