More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4348 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4348  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
313 aa  621  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.95 
 
 
317 aa  248  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.38 
 
 
314 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.58 
 
 
320 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.94 
 
 
313 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
328 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
327 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
333 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.2 
 
 
336 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  0.659937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
322 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
333 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 
326 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1503  alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 
320 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00185871  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6236  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.98 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547714  normal  0.621953 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.93 
 
 
332 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.37 
 
 
322 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  37.34 
 
 
312 aa  179  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
313 aa  178  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
329 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.63 
 
 
332 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.94 
 
 
324 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2309  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.59 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1997  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.03 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.03 
 
 
332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.03 
 
 
332 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3538  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
327 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3545  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.72 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.03 
 
 
332 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.03 
 
 
332 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.03 
 
 
332 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
332 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.13 
 
 
332 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  31.53 
 
 
305 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.28 
 
 
302 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0108316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0176  alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 
302 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261853  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 
337 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  34.38 
 
 
302 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1822  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.44 
 
 
318 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00782969  normal  0.0887564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
327 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1584  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  31.77 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1504  alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0165  alcohol dehydrogenase, zinc containing  33.96 
 
 
302 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.48 
 
 
307 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2633  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.52 
 
 
367 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000713978  hitchhiker  0.00104342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1726  alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 
320 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0198  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.59 
 
 
302 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000282555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  38.5 
 
 
317 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.75 
 
 
318 aa  165  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0221  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.23 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.5 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.03 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.47 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.79 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0197  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.96 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0162  alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 
302 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  32.92 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4198  alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00226105  normal  0.135586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.97 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0201  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.23 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.72 
 
 
338 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.12 
 
 
310 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1829  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.76 
 
 
312 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000146701  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.69 
 
 
302 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  35.15 
 
 
304 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.76 
 
 
313 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 
321 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.91 
 
 
333 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  32.13 
 
 
323 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  35.29 
 
 
308 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5105  putative alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 
318 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1586  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
330 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  32.83 
 
 
325 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.05 
 
 
331 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
330 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
326 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3063  secretion protein HlyD  32.41 
 
 
324 aa  156  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0569079  hitchhiker  0.0000550931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
308 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5041  alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 
323 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750804  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3717  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.33 
 
 
322 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.04 
 
 
333 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  33.84 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.28 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6510  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.19 
 
 
309 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.267083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
333 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.43 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  33.53 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.7 
 
 
333 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.84 
 
 
331 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.38 
 
 
307 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1606  putative adh_zinc, zinc-binding dehydrogenase  32.73 
 
 
325 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.265737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
333 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
333 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>