More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1047 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
336 aa  675    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  0.659937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  54.74 
 
 
328 aa  361  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  47.43 
 
 
327 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  45.57 
 
 
324 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  46.22 
 
 
327 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  44.11 
 
 
326 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4198  alcohol dehydrogenase  47.09 
 
 
323 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00226105  normal  0.135586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.57 
 
 
322 aa  249  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1997  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.57 
 
 
341 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3538  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.29 
 
 
327 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3717  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.43 
 
 
322 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3545  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.55 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.25 
 
 
323 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.94 
 
 
327 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1586  alcohol dehydrogenase  46.39 
 
 
330 aa  222  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.16 
 
 
338 aa  219  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1504  alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 
333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0165  alcohol dehydrogenase, zinc containing  37.24 
 
 
302 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0198  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.54 
 
 
302 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000282555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.94 
 
 
302 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0108316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  37.05 
 
 
302 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.84 
 
 
302 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0176  alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 
302 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2633  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.59 
 
 
367 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000713978  hitchhiker  0.00104342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0221  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.54 
 
 
302 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0201  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.84 
 
 
302 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1503  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
320 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00185871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0162  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
302 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
320 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.76 
 
 
314 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1726  alcohol dehydrogenase  41.52 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 
329 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0197  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.34 
 
 
302 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1822  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.34 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00782969  normal  0.0887564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  40.12 
 
 
313 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.02 
 
 
327 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1687  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.17 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
331 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2823  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 
320 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000866772  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2642  putative zinc-binding oxidoreductase  42.73 
 
 
330 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.71048  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.73 
 
 
332 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.02 
 
 
332 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 
333 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.02 
 
 
332 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 
333 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4348  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.2 
 
 
313 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.87 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.44 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.73 
 
 
332 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.14 
 
 
332 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
337 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.73 
 
 
332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.73 
 
 
332 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.73 
 
 
332 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
332 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  34.66 
 
 
304 aa  178  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
333 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3963  NADPH:quinone reductase  38.67 
 
 
317 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.93 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  36.39 
 
 
312 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2978  putative zinc-binding oxidoreductase  36.78 
 
 
322 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.914208  normal  0.14006 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  32.93 
 
 
317 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.63 
 
 
317 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
339 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  34.21 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.04 
 
 
310 aa  165  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.41 
 
 
333 aa  165  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2400  alcohol dehydrogenase  36.56 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0596045  hitchhiker  0.000337356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  31.52 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
320 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
333 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.5 
 
 
333 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
333 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 
333 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
339 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3063  secretion protein HlyD  33.53 
 
 
324 aa  159  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0569079  hitchhiker  0.0000550931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5041  alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
323 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750804  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
333 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  33.44 
 
 
305 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.88 
 
 
333 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
333 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  31.72 
 
 
308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 
313 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.84 
 
 
334 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
326 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.56 
 
 
326 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
323 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.94 
 
 
332 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
333 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.5 
 
 
333 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  33.97 
 
 
333 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.54 
 
 
333 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1829  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.93 
 
 
312 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000146701  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.56 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>