More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1687 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1687  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
322 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4198  alcohol dehydrogenase  64.4 
 
 
323 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00226105  normal  0.135586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3717  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.73 
 
 
322 aa  344  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1997  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.1 
 
 
341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.72 
 
 
338 aa  325  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3545  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56 
 
 
339 aa  325  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.11 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  52.96 
 
 
324 aa  312  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2633  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.87 
 
 
367 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000713978  hitchhiker  0.00104342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 
322 aa  291  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
328 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  48.01 
 
 
326 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.94 
 
 
322 aa  282  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 
327 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  47.26 
 
 
327 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3963  NADPH:quinone reductase  51.39 
 
 
317 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2823  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.35 
 
 
320 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000866772  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1504  alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 
333 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.17 
 
 
336 aa  242  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  0.659937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3538  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.09 
 
 
327 aa  235  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1726  alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.97 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.09 
 
 
327 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2642  putative zinc-binding oxidoreductase  41.69 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.71048  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0197  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35 
 
 
302 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.89 
 
 
313 aa  208  9e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0165  alcohol dehydrogenase, zinc containing  35 
 
 
302 aa  208  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35 
 
 
302 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0108316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0176  alcohol dehydrogenase  35 
 
 
302 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  35.76 
 
 
302 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0201  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.21 
 
 
302 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.5 
 
 
302 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1586  alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 
330 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.72 
 
 
314 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
329 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0162  alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0221  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.12 
 
 
302 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1503  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
320 aa  198  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00185871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0198  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.02 
 
 
302 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000282555  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2978  putative zinc-binding oxidoreductase  36.59 
 
 
322 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.914208  normal  0.14006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5457  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.92 
 
 
315 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331783  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1822  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.64 
 
 
318 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00782969  normal  0.0887564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
320 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3697  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.99 
 
 
335 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.497313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.8 
 
 
317 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.88 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.54 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.23 
 
 
317 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.88 
 
 
332 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.18 
 
 
332 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  33.23 
 
 
317 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.4 
 
 
310 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.59 
 
 
332 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5041  alcohol dehydrogenase  38.11 
 
 
323 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750804  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.77 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.07 
 
 
332 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.47 
 
 
333 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
337 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.07 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.47 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3063  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0569079  hitchhiker  0.0000550931 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.38 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.81 
 
 
338 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 
333 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 
333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
333 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.76 
 
 
332 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  32.44 
 
 
339 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.89 
 
 
326 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 
333 aa  159  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.82 
 
 
333 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
308 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4234  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  46.86 
 
 
480 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0877604  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2400  alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
329 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0596045  hitchhiker  0.000337356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.41 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  32.25 
 
 
333 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.88 
 
 
333 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4348  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32 
 
 
313 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  32.82 
 
 
308 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
348 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
326 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.51 
 
 
319 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  33.64 
 
 
304 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.79 
 
 
333 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 
323 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.56 
 
 
314 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.71 
 
 
326 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.81 
 
 
333 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  30.88 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  30.59 
 
 
331 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1829  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.83 
 
 
312 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000146701  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
326 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>