More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2978 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2978  putative zinc-binding oxidoreductase  100 
 
 
322 aa  660    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.914208  normal  0.14006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1504  alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 
333 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.6 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 
328 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  37.12 
 
 
327 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2642  putative zinc-binding oxidoreductase  40.06 
 
 
330 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.71048  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1822  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.44 
 
 
318 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00782969  normal  0.0887564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
322 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3717  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.95 
 
 
322 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1503  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
320 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00185871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.66 
 
 
323 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1726  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
320 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4198  alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
323 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00226105  normal  0.135586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 
326 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.76 
 
 
317 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.96 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.59 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.56 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.78 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  0.659937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3538  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.05 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3545  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.17 
 
 
339 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0165  alcohol dehydrogenase, zinc containing  34.04 
 
 
302 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.74 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0108316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0176  alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0197  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.74 
 
 
302 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0162  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
302 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.53 
 
 
302 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0201  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.53 
 
 
302 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  33.53 
 
 
302 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0198  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.23 
 
 
302 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000282555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3963  NADPH:quinone reductase  34.86 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.03 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0221  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.23 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569438  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1997  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.82 
 
 
341 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1687  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.59 
 
 
322 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3697  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.28 
 
 
335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.497313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
329 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2633  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.63 
 
 
367 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000713978  hitchhiker  0.00104342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3063  secretion protein HlyD  35.86 
 
 
324 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0569079  hitchhiker  0.0000550931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
320 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.6 
 
 
313 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2823  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.19 
 
 
320 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000866772  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1586  alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 
330 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.19 
 
 
327 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2330  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.95 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700885  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4348  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.97 
 
 
313 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185059 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
331 aa  147  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
333 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.2 
 
 
338 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 
337 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
333 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.66 
 
 
334 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.59 
 
 
308 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.31 
 
 
310 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2638  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.9 
 
 
322 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.418138  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.2 
 
 
332 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.32 
 
 
333 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  32.78 
 
 
308 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5041  alcohol dehydrogenase  29.54 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750804  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  27.41 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.92 
 
 
333 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.64 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  30.46 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.06 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.32 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.45 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.71 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.74 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.06 
 
 
334 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.45 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.27 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.95 
 
 
333 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.45 
 
 
332 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  26.53 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.45 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.98 
 
 
329 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  27.11 
 
 
333 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.66 
 
 
313 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5105  putative alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
318 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  25.15 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  29.94 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.51 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  29.14 
 
 
317 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.82 
 
 
639 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.91 
 
 
333 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  29.48 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  25.36 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
313 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1696  hypothetical protein  31.12 
 
 
333 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.27 
 
 
318 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.75 
 
 
332 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
333 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>