More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2330 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2330  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
314 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700885  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.09 
 
 
313 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.59 
 
 
326 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  39.56 
 
 
314 aa  215  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  39.87 
 
 
312 aa  212  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.24 
 
 
310 aa  202  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.61 
 
 
319 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.99 
 
 
317 aa  198  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.28 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  39.68 
 
 
325 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.01 
 
 
332 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.1 
 
 
334 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5695  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.64 
 
 
343 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.42 
 
 
332 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.42 
 
 
332 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.42 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.14 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.17 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  37.31 
 
 
339 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.12 
 
 
332 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.42 
 
 
332 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.93 
 
 
338 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.38 
 
 
314 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  35.76 
 
 
313 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 
308 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.36 
 
 
314 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.42 
 
 
332 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.54 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.82 
 
 
332 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
333 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
333 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.12 
 
 
339 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.51 
 
 
333 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.38 
 
 
315 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.54 
 
 
313 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  37.11 
 
 
323 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.62 
 
 
311 aa  175  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.49 
 
 
639 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
331 aa  172  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  35.22 
 
 
308 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  33.53 
 
 
333 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.44 
 
 
333 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
320 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.76 
 
 
323 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
333 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
333 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
333 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.66 
 
 
333 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
339 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  34.93 
 
 
339 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  35.35 
 
 
304 aa  168  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.38 
 
 
329 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.59 
 
 
317 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
317 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.74 
 
 
333 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
348 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
329 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.22 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.63 
 
 
333 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.24 
 
 
338 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.96 
 
 
317 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0201  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.08 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  33.96 
 
 
317 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3063  secretion protein HlyD  33.74 
 
 
324 aa  162  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0569079  hitchhiker  0.0000550931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  33.65 
 
 
305 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.85 
 
 
334 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.96 
 
 
308 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.08 
 
 
313 aa  159  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  33.44 
 
 
308 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.44 
 
 
332 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.95 
 
 
333 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
339 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 
321 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0221  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.57 
 
 
302 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.26 
 
 
302 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3717  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.53 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  37.54 
 
 
317 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0162  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
302 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0198  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.64 
 
 
302 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000282555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  31.6 
 
 
333 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
334 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1020  quinone oxidoreductase  32.59 
 
 
315 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.740068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.91 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.33 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0108316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0176  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  33.84 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
327 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.64 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.39 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0165  alcohol dehydrogenase, zinc containing  33.33 
 
 
302 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  33.02 
 
 
302 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5628  alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
308 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>