More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1829 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1829  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
312 aa  633  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000146701  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.74 
 
 
314 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
320 aa  202  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.56 
 
 
317 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.63 
 
 
334 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.73 
 
 
332 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.73 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.13 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.03 
 
 
313 aa  179  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.43 
 
 
332 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.13 
 
 
332 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.43 
 
 
332 aa  178  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.43 
 
 
332 aa  178  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.13 
 
 
332 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
332 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 
328 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  35.84 
 
 
331 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  35.84 
 
 
331 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.84 
 
 
331 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.82 
 
 
338 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.03 
 
 
335 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.15 
 
 
331 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 
335 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.83 
 
 
308 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.96 
 
 
317 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 
317 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
333 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.73 
 
 
333 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
333 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  32.34 
 
 
333 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  35.24 
 
 
308 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  34.07 
 
 
304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
331 aa  165  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.03 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.03 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.23 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.33 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1584  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  33.44 
 
 
310 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.93 
 
 
333 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2638  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.418138  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.15 
 
 
331 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.24 
 
 
333 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.6 
 
 
318 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.83 
 
 
333 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
333 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  33.02 
 
 
317 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.05 
 
 
327 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.13 
 
 
323 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
333 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.67 
 
 
639 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
327 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1504  alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 
333 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.92 
 
 
310 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
333 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
333 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 
326 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.85 
 
 
310 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4348  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.76 
 
 
313 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0201  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.82 
 
 
302 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1503  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
320 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00185871  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
321 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
333 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 
333 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2309  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.52 
 
 
309 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.6 
 
 
314 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  31.55 
 
 
308 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.97 
 
 
311 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0221  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.6 
 
 
302 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1606  putative adh_zinc, zinc-binding dehydrogenase  35.06 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.265737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2444  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.18 
 
 
312 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.73 
 
 
330 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0162  alcohol dehydrogenase  31.6 
 
 
302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  31.6 
 
 
302 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.04 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5105  putative alcohol dehydrogenase  35.02 
 
 
318 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
325 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.82 
 
 
302 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.12 
 
 
334 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.93 
 
 
329 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0198  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.6 
 
 
302 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000282555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4198  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
323 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00226105  normal  0.135586 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  34.92 
 
 
317 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  32.38 
 
 
323 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  32.49 
 
 
305 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.61 
 
 
334 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.62 
 
 
307 aa  149  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.07 
 
 
314 aa  148  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
348 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.69 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37060  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  33.73 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.94 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6236  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.96 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547714  normal  0.621953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.93 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>