More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4293 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4293  NADPH:quinone reductase  100 
 
 
308 aa  607  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213277  normal  0.0250565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  58.82 
 
 
307 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  57.84 
 
 
307 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  45.78 
 
 
308 aa  248  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  41.94 
 
 
313 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  45.9 
 
 
321 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  44.48 
 
 
323 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  45.22 
 
 
326 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  46.03 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  41.94 
 
 
312 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  44.16 
 
 
317 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  41.83 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  39.3 
 
 
308 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 
331 aa  211  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.29 
 
 
308 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  43.59 
 
 
314 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.9 
 
 
307 aa  205  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.17 
 
 
319 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.69 
 
 
314 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  40.58 
 
 
304 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.58 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.48 
 
 
333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  39.3 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.1 
 
 
320 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.36 
 
 
317 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
317 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.45 
 
 
314 aa  199  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.78 
 
 
310 aa  198  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.83 
 
 
317 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  36.05 
 
 
317 aa  195  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.3 
 
 
326 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.99 
 
 
308 aa  195  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.64 
 
 
332 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.64 
 
 
332 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.64 
 
 
332 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.39 
 
 
333 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.34 
 
 
332 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.14 
 
 
332 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
332 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.38 
 
 
311 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 
339 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.78 
 
 
308 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.34 
 
 
332 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  46.18 
 
 
313 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5628  alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
308 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.32 
 
 
333 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 
334 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.04 
 
 
332 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.18 
 
 
328 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.14 
 
 
333 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 
333 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  39.05 
 
 
312 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.81 
 
 
323 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4637  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.42 
 
 
309 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.05 
 
 
333 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.69 
 
 
317 aa  185  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.34 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.73 
 
 
332 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1050  alcohol dehydrogenase  42.49 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.55 
 
 
338 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
339 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.1 
 
 
317 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  39.37 
 
 
307 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40 
 
 
334 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 
333 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.05 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.95 
 
 
333 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.62 
 
 
313 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.95 
 
 
334 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
333 aa  178  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 
337 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 
333 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.25 
 
 
333 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 
326 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
333 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  37.58 
 
 
333 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 
333 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.14 
 
 
324 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37060  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  39.39 
 
 
331 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.63 
 
 
639 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.25 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.64 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.23 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1020  quinone oxidoreductase  38.05 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.740068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.43 
 
 
334 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.96 
 
 
330 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 
339 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  34.94 
 
 
333 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.13 
 
 
334 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 
322 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6211  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.46 
 
 
314 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5695  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.69 
 
 
343 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 
348 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.84 
 
 
338 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.12 
 
 
339 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>