More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4637 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4637  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
309 aa  594  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3903  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  73.87 
 
 
314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.45 
 
 
314 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.632176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2213  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2209  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.84 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6510  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.52 
 
 
309 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.267083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.64 
 
 
311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3931  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.99 
 
 
301 aa  268  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198991  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1183  alcohol dehydrogenase  54.63 
 
 
314 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.300688  normal  0.0513369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  46.15 
 
 
584 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  37.62 
 
 
308 aa  202  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  40.61 
 
 
307 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  40.63 
 
 
313 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.58 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  35.35 
 
 
313 aa  178  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.72 
 
 
308 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 
321 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.19 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 
308 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.46 
 
 
329 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 
312 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  38.78 
 
 
317 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  38.23 
 
 
323 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.82 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  38.65 
 
 
314 aa  162  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  37.26 
 
 
326 aa  162  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  36.33 
 
 
305 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.88 
 
 
328 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  36.23 
 
 
333 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  34.52 
 
 
358 aa  158  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  35.26 
 
 
304 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4293  NADPH:quinone reductase  41.42 
 
 
308 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213277  normal  0.0250565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 
307 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.95 
 
 
307 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1584  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  33.9 
 
 
310 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.44 
 
 
319 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1050  alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
320 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 
333 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.91 
 
 
339 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  34.7 
 
 
337 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.18 
 
 
334 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.38 
 
 
338 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  37.62 
 
 
307 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
320 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.8 
 
 
308 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  34.24 
 
 
326 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
314 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
322 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5628  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
308 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  36.23 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.02 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.14 
 
 
318 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  29.9 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.01 
 
 
307 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.61 
 
 
317 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.12 
 
 
317 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
317 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.83 
 
 
333 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  39.41 
 
 
317 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.41 
 
 
317 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.25 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2309  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.56 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.3 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.63 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7251  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.62 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
339 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.96 
 
 
311 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4019  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.13 
 
 
317 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.209092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
331 aa  139  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4348  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.88 
 
 
313 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.64 
 
 
313 aa  139  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3312  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
320 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2444  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.69 
 
 
312 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3363  alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
333 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  33.54 
 
 
312 aa  138  8.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.38 
 
 
307 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
338 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
339 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0872  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.94 
 
 
302 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.96562 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 
333 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.11 
 
 
333 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6236  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.44 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547714  normal  0.621953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5710  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
324 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.97 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  41.95 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.58 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5331  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5420  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
348 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0066  alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
309 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.23 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43 
 
 
328 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
333 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2447  alcohol dehydrogenase  44.09 
 
 
331 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
316 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.46 
 
 
334 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>