More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2444 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2444  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
312 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2638  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.56 
 
 
322 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.418138  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5105  putative alcohol dehydrogenase  58.73 
 
 
318 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.57 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.31 
 
 
318 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.6 
 
 
313 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.69 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.38 
 
 
322 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.04 
 
 
324 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.81 
 
 
333 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
333 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.73 
 
 
333 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.7 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  36.56 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3963  NADPH:quinone reductase  40.73 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.9 
 
 
302 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0108316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0165  alcohol dehydrogenase, zinc containing  32.32 
 
 
302 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0221  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.62 
 
 
302 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569438  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3545  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.82 
 
 
339 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0176  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
302 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.84 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.02 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0162  alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0198  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.21 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000282555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.85 
 
 
323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.95 
 
 
327 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 
327 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  32.7 
 
 
317 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  35.78 
 
 
326 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.23 
 
 
332 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
328 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.23 
 
 
332 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.23 
 
 
332 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
332 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
348 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.01 
 
 
333 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.38 
 
 
317 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.93 
 
 
332 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.44 
 
 
332 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0201  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.43 
 
 
302 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  31.9 
 
 
302 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0197  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.6 
 
 
302 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.84 
 
 
332 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
333 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  34.91 
 
 
308 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.93 
 
 
333 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.93 
 
 
332 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  39.87 
 
 
325 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.93 
 
 
302 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 
333 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
333 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 
333 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
326 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.13 
 
 
329 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 
327 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
329 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.53 
 
 
338 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  30.91 
 
 
308 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
337 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1829  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.18 
 
 
312 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000146701  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.92 
 
 
323 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
333 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1997  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.34 
 
 
341 aa  152  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
333 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.74 
 
 
333 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  36.71 
 
 
312 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  32.62 
 
 
331 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4732  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.61 
 
 
328 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  35.24 
 
 
304 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5041  alcohol dehydrogenase  38.2 
 
 
323 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750804  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.93 
 
 
335 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  32.32 
 
 
331 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
335 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.88 
 
 
308 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 
331 aa  149  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3717  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.47 
 
 
322 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  33.86 
 
 
312 aa  149  7e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.25 
 
 
310 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.22 
 
 
326 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  37.9 
 
 
305 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
339 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2642  putative zinc-binding oxidoreductase  39.57 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.71048  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.01 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.29 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.32 
 
 
331 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.34 
 
 
308 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.23 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.44 
 
 
639 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.77 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.08 
 
 
317 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  39.76 
 
 
324 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  31.94 
 
 
333 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.32 
 
 
331 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.27 
 
 
332 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1503  alcohol dehydrogenase  31.8 
 
 
320 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00185871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>