More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3312 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3312  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
320 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0231  alcohol dehydrogenase  65.31 
 
 
320 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000570336  unclonable  8.70956e-23 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.01 
 
 
323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4426  alcohol dehydrogenase  43.71 
 
 
319 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.27 
 
 
327 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  35.49 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
329 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.39 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.69 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
322 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  36.11 
 
 
336 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.15 
 
 
328 aa  169  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  36 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.65 
 
 
341 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.69 
 
 
320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  35.78 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.18 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  33.95 
 
 
328 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.17 
 
 
334 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
334 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.26 
 
 
328 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  34.37 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
325 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.75 
 
 
325 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  34.26 
 
 
328 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  33.33 
 
 
325 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  33.95 
 
 
328 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  32.52 
 
 
331 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.95 
 
 
328 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  33.54 
 
 
308 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  34.06 
 
 
325 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.23 
 
 
324 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  32.22 
 
 
331 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
342 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.62 
 
 
342 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3409  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.09 
 
 
333 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149484  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.15 
 
 
323 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.91 
 
 
331 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.46 
 
 
320 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.52 
 
 
331 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
353 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32 
 
 
350 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
335 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.85 
 
 
324 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.25 
 
 
335 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.22 
 
 
331 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
325 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 
335 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0064  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
333 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.33 
 
 
328 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.82 
 
 
324 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.23 
 
 
335 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1998  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.73 
 
 
318 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  33.64 
 
 
328 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
325 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  33.64 
 
 
328 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
333 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
321 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
322 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.09 
 
 
308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.04 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
328 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
318 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 
327 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
332 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.85 
 
 
325 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.51 
 
 
328 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.33 
 
 
326 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
353 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
334 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
324 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
324 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.94 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.77 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.46 
 
 
323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.72 
 
 
328 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
324 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 
325 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.88 
 
 
324 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.37 
 
 
326 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
320 aa  153  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
323 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  34.56 
 
 
328 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.54 
 
 
329 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.31 
 
 
322 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.46 
 
 
342 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.69 
 
 
323 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.14 
 
 
334 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
326 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  30.67 
 
 
324 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.44 
 
 
326 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.84 
 
 
338 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
326 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
328 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
326 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.25 
 
 
336 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>