More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0231 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0231  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 320 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000570336  unclonable  8.70956e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3312  alcohol dehydrogenase  65.31 
 
 		 320 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.01 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4426  alcohol dehydrogenase  43.4 
 
 		 319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.2 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.98 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.24 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2099  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.83 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.88 
 
 		 328 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  34.06 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  33.75 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.88 
 
 		 327 aa  168  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  35.28 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  33.95 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  34.88 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  34.26 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  34.26 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.45 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  36.68 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.26 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  36.28 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.26 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  34.36 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.2 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.62 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.91 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.98 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.35 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.38 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.46 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.98 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.88 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.28 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  35.49 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  34.88 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  34.88 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.13 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.69 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.08 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  35.89 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  36.39 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.15 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 		 353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.14 
 
 		 324 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.69 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.54 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.62 
 
 		 342 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.12 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  35.38 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.23 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.77 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3409  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.92 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  35.05 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 329 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.66 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.9 
 
 		 341 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 		 325 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 		 335 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.11 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.58 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  33.33 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3028  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  35.06 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.97 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.55 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.28 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.36 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 325 aa  149  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.45 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.08 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.28 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.44 
 
 		 335 aa  149  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 		 325 aa  149  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  35.78 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.43 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>