More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4700 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
339 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  72.84 
 
 
338 aa  504  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  68.75 
 
 
339 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  64.99 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.77 
 
 
334 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5695  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.8 
 
 
343 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.1 
 
 
334 aa  345  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
312 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  36.72 
 
 
308 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 
308 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 
325 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 
321 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  36.95 
 
 
313 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  39.4 
 
 
323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.53 
 
 
314 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
320 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.29 
 
 
314 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.9 
 
 
314 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  39.52 
 
 
317 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.06 
 
 
319 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.8 
 
 
326 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.09 
 
 
323 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
308 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  40.12 
 
 
314 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  36.31 
 
 
312 aa  188  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
331 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.07 
 
 
315 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.06 
 
 
310 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  38.92 
 
 
313 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  32.04 
 
 
304 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.9 
 
 
317 aa  185  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1050  alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
320 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.84 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.72 
 
 
329 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.04 
 
 
313 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
333 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.06 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 
337 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.35 
 
 
338 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.61 
 
 
308 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.76 
 
 
311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.77 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.6 
 
 
639 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
333 aa  173  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.96 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  32.43 
 
 
305 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.99 
 
 
332 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3826  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.03 
 
 
311 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.0906959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
333 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
339 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
328 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2330  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.12 
 
 
314 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700885  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.55 
 
 
332 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.96 
 
 
333 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
307 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.84 
 
 
334 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.99 
 
 
332 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.7 
 
 
332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  33.43 
 
 
308 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
326 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.7 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.42 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.99 
 
 
333 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
307 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.42 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.7 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.7 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.87 
 
 
334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 
339 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
333 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  32.35 
 
 
317 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.47 
 
 
317 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.52 
 
 
333 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2213  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.33 
 
 
310 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  31.47 
 
 
317 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.06 
 
 
317 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
322 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
333 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  31.37 
 
 
333 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.82 
 
 
307 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6510  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.8 
 
 
309 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.267083 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.29 
 
 
330 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.83 
 
 
317 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.8 
 
 
311 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4637  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.91 
 
 
309 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1020  quinone oxidoreductase  31.87 
 
 
315 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.740068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
333 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.86 
 
 
333 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.07 
 
 
337 aa  156  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.85 
 
 
332 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3063  secretion protein HlyD  31.9 
 
 
324 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0569079  hitchhiker  0.0000550931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.21 
 
 
308 aa  155  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.26 
 
 
328 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  35.34 
 
 
307 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.94 
 
 
313 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>