More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0756 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0756  putative quinone oxidoreductase  100 
 
 
257 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000103949  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3856  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  100 
 
 
327 aa  507  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.323591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3766  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  100 
 
 
327 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4450  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  82.8 
 
 
329 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.553295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  82.73 
 
 
327 aa  427  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  82.33 
 
 
328 aa  421  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0742  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  81.12 
 
 
329 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  79.92 
 
 
331 aa  410  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4587  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  76.71 
 
 
327 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  76.71 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  76.71 
 
 
327 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  76.71 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4639  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  76.31 
 
 
327 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0687735 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  75.5 
 
 
327 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  75.1 
 
 
327 aa  387  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  75.5 
 
 
327 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  75.5 
 
 
327 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  75.5 
 
 
327 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  75.5 
 
 
327 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03883  hypothetical protein  75.5 
 
 
327 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  75.5 
 
 
327 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0255  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  76.31 
 
 
327 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.263787  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4544  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  74.7 
 
 
327 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  66.67 
 
 
325 aa  341  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  66.67 
 
 
325 aa  341  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  66.67 
 
 
325 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.86 
 
 
325 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  65.86 
 
 
325 aa  338  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  65.46 
 
 
325 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66 
 
 
325 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0173  quinone oxidoreductase  65.46 
 
 
325 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0059  alcohol dehydrogenase  66.27 
 
 
325 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  65.86 
 
 
325 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  65.06 
 
 
325 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  64.26 
 
 
325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  56.63 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.26 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  55.91 
 
 
325 aa  281  9e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  56.33 
 
 
324 aa  275  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.94 
 
 
324 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.75 
 
 
326 aa  271  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.33 
 
 
326 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.73 
 
 
323 aa  270  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  55.12 
 
 
327 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  55.12 
 
 
327 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  55.12 
 
 
327 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  56.45 
 
 
326 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  55.12 
 
 
327 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  55.12 
 
 
327 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  55.12 
 
 
327 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  57.89 
 
 
327 aa  269  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  53.63 
 
 
330 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  52.36 
 
 
324 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.36 
 
 
324 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  52.36 
 
 
324 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.88 
 
 
327 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  54.66 
 
 
328 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  52.36 
 
 
324 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.17 
 
 
328 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  51.57 
 
 
324 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.57 
 
 
324 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  51.57 
 
 
324 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.57 
 
 
324 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  51.57 
 
 
324 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  51.57 
 
 
324 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  51.57 
 
 
324 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  54.66 
 
 
331 aa  262  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.23 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  51.97 
 
 
324 aa  261  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  52.36 
 
 
324 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  52.36 
 
 
324 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.66 
 
 
326 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4628  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  54.29 
 
 
412 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.29 
 
 
324 aa  258  9e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  50.79 
 
 
324 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.39 
 
 
324 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  50 
 
 
324 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 
326 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.04 
 
 
331 aa  255  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  52.38 
 
 
327 aa  254  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.04 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.2 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  53.41 
 
 
324 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.15 
 
 
322 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  52.23 
 
 
326 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  53.44 
 
 
326 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
326 aa  251  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  54.36 
 
 
321 aa  250  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  51.43 
 
 
324 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.84 
 
 
323 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  52.73 
 
 
324 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  50.79 
 
 
327 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  56 
 
 
325 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  51.82 
 
 
326 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.55 
 
 
326 aa  248  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1614  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.21 
 
 
260 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.11 
 
 
326 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.61 
 
 
344 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  51.55 
 
 
326 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.76 
 
 
322 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>