More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2576 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
329 aa  656    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  73.86 
 
 
329 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  73.25 
 
 
329 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  71.12 
 
 
330 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  60.79 
 
 
328 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  61.09 
 
 
329 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  59.27 
 
 
330 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  58.05 
 
 
329 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.75 
 
 
329 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  57.75 
 
 
329 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  56.84 
 
 
329 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.75 
 
 
329 aa  361  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  53.94 
 
 
360 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  51.67 
 
 
329 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.37 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  49.54 
 
 
337 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  48.34 
 
 
333 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.03 
 
 
338 aa  278  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.45 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.84 
 
 
337 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.78 
 
 
326 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.21 
 
 
331 aa  220  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.64 
 
 
326 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2955  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
340 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574608  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 
323 aa  192  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2827  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.12 
 
 
340 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2912  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.12 
 
 
340 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823594  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2862  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
340 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  33.83 
 
 
340 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2977  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
340 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0293336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32420  putative oxidoreductase  34.12 
 
 
339 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366639  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2747  putative oxidoreductase  34.12 
 
 
339 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2184  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
340 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.742883  normal  0.0144783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.91 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.324261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2667  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.44 
 
 
340 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.83 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.52 
 
 
328 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
328 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 
325 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  35.15 
 
 
324 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
330 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 
331 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.12 
 
 
326 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
326 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.54 
 
 
326 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 
328 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.14 
 
 
342 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
331 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
326 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  34.45 
 
 
326 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  33.75 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.03 
 
 
326 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
323 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
325 aa  153  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.54 
 
 
328 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
327 aa  152  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 
322 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
326 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  32.93 
 
 
325 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
322 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
321 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  32.22 
 
 
328 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.63 
 
 
324 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
324 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  32.22 
 
 
328 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
326 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  33.03 
 
 
325 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.61 
 
 
327 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
325 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  32.05 
 
 
327 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  33.83 
 
 
349 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  32.05 
 
 
327 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  32.05 
 
 
327 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  32.05 
 
 
327 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  32.05 
 
 
327 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  32.05 
 
 
327 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.52 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  33.73 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.63 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.91 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 
333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.73 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.04 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  33.73 
 
 
324 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  33.73 
 
 
324 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  32.93 
 
 
389 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.73 
 
 
324 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  33.73 
 
 
324 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  33.73 
 
 
324 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.52 
 
 
332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
324 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
339 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  31.91 
 
 
328 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.25 
 
 
322 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>