More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3217 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
326 aa  638    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.37 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.69 
 
 
326 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  43.64 
 
 
333 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  44.07 
 
 
329 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  45.15 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.55 
 
 
332 aa  235  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
329 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  42.86 
 
 
360 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  41.34 
 
 
329 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
329 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
329 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
329 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 
329 aa  222  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.64 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  43.47 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.77 
 
 
329 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.9 
 
 
329 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
330 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  39.39 
 
 
337 aa  205  9e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.09 
 
 
337 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.11 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
333 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.08 
 
 
317 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.82 
 
 
326 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2912  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.5 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823594  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.73 
 
 
314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.86 
 
 
639 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
323 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
339 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
330 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32420  putative oxidoreductase  31.75 
 
 
339 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366639  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  31.19 
 
 
340 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
328 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.04 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.13 
 
 
328 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
326 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
328 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  32.15 
 
 
340 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.324261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.94 
 
 
338 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2747  putative oxidoreductase  31.45 
 
 
339 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.77 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2184  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.742883  normal  0.0144783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2667  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.18 
 
 
340 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
325 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.48 
 
 
342 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2827  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.67 
 
 
340 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2862  alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 
340 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2977  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
340 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0293336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
322 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.01 
 
 
342 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.43 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.9 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0568  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.01 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
331 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.73 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
342 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.93 
 
 
334 aa  132  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
322 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.42 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  34.66 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.08 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.33 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  33.03 
 
 
389 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  32.83 
 
 
324 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2955  alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
340 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574608  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.31 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.39 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.64 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.45 
 
 
336 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
331 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.37 
 
 
336 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  31.42 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  31.42 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.62 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.42 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  31.74 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  33.74 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.14 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.16 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.42 
 
 
330 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
325 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.74 
 
 
332 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.58 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
324 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.93 
 
 
328 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  36.54 
 
 
319 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0488  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
318 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.630046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
313 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.71 
 
 
320 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.66 
 
 
337 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
327 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.45 
 
 
324 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>