More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32420 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2747  putative oxidoreductase  97.94 
 
 
339 aa  677    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32420  putative oxidoreductase  100 
 
 
339 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366639  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2184  alcohol dehydrogenase  68.05 
 
 
340 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.742883  normal  0.0144783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  62.91 
 
 
340 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.324261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  60.53 
 
 
340 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2912  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.94 
 
 
340 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823594  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2955  alcohol dehydrogenase  58.88 
 
 
340 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574608  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2977  alcohol dehydrogenase  59.05 
 
 
340 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0293336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2827  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.28 
 
 
340 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2862  alcohol dehydrogenase  58.28 
 
 
340 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2667  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.75 
 
 
340 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.73 
 
 
337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  36.5 
 
 
360 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
329 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.82 
 
 
329 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
330 aa  195  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
329 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
330 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  33.53 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.12 
 
 
329 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
329 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
329 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
329 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
329 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.14 
 
 
332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.74 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.83 
 
 
329 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.45 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  28.36 
 
 
337 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.06 
 
 
326 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
323 aa  152  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.54 
 
 
331 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
332 aa  142  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  31.86 
 
 
389 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  33.04 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  33.04 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  33.04 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  33.04 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  33.04 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  33.04 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.44 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  30.47 
 
 
332 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
329 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.75 
 
 
326 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
326 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  32.43 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.13 
 
 
324 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 
327 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.14 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.74 
 
 
327 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.53 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0541  alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 
332 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.36 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.55 
 
 
332 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
322 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.14 
 
 
327 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
324 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.87 
 
 
326 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.06 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.34 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.03 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  30.37 
 
 
2523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3252  alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.44 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.5 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  32.44 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.75 
 
 
328 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  32.44 
 
 
336 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.34 
 
 
323 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 
2500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.6 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
329 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
329 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
329 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.88 
 
 
338 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.59 
 
 
332 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3411  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
332 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0690188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  31.42 
 
 
353 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.44 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.91 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  33.33 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  30.38 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.25 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.73 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
328 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.14 
 
 
322 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>