More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0197 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  38.58 
 
 		 2507 aa  681    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  33.5 
 
 		 2547 aa  1243    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  39.65 
 
 		 2468 aa  1489    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  39.82 
 
 		 2492 aa  1528    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2500 aa  5065    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  40.78 
 
 		 2545 aa  773    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  39.48 
 
 		 2468 aa  1503    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  39.47 
 
 		 2546 aa  764    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  35.25 
 
 		 2486 aa  653    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  34.53 
 
 		 2499 aa  1236    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  39.51 
 
 		 2546 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  39.75 
 
 		 2556 aa  766    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  35.25 
 
 		 2486 aa  653    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  39.34 
 
 		 2545 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  40.38 
 
 		 2476 aa  1520    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  39.73 
 
 		 2485 aa  1530    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  35.17 
 
 		 2543 aa  1217    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  40.35 
 
 		 2544 aa  772    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  27.48 
 
 		 2551 aa  813    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  40.02 
 
 		 2484 aa  1472    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  38.67 
 
 		 2492 aa  1499    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  40.35 
 
 		 2544 aa  772    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  39.61 
 
 		 2468 aa  1498    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  57.28 
 
 		 2523 aa  2757    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  39.56 
 
 		 2460 aa  785    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  39.51 
 
 		 2546 aa  763    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  39.51 
 
 		 2546 aa  763    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  39.51 
 
 		 2546 aa  763    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  39.53 
 
 		 2546 aa  763    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  39.6 
 
 		 2546 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  35.76 
 
 		 2352 aa  622  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.22 
 
 		 1804 aa  589  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  31.73 
 
 		 1939 aa  557  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  41.47 
 
 		 2543 aa  553  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.97 
 
 		 3111 aa  549  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  36.45 
 
 		 1144 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  30.95 
 
 		 2333 aa  539  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  32.64 
 
 		 2232 aa  538  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  30.31 
 
 		 2230 aa  531  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.52 
 
 		 1822 aa  523  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  32.54 
 
 		 1832 aa  521  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 1874 aa  515  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.04 
 
 		 2462 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 		 7110 aa  512  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  32.69 
 
 		 3101 aa  511  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  31.68 
 
 		 2225 aa  512  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  31.72 
 
 		 3676 aa  513  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  32.71 
 
 		 3176 aa  509  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  31.73 
 
 		 3693 aa  510  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  31.73 
 
 		 3693 aa  510  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  33.71 
 
 		 3930 aa  505  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.98 
 
 		 1867 aa  505  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  31.56 
 
 		 3702 aa  506  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  34.17 
 
 		 4151 aa  501  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  34.58 
 
 		 3696 aa  503  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  32.28 
 
 		 3679 aa  499  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  35.76 
 
 		 1656 aa  499  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  31.63 
 
 		 4183 aa  501  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  32.31 
 
 		 2108 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  30.28 
 
 		 2085 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  30.02 
 
 		 2085 aa  493  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.06 
 
 		 1087 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  30.02 
 
 		 2085 aa  493  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  32.12 
 
 		 2277 aa  493  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  32 
 
 		 3080 aa  488  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  32.86 
 
 		 2126 aa  489  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  36.24 
 
 		 2880 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  31.68 
 
 		 2719 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.82 
 
 		 2136 aa  487  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.27 
 
 		 4478 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.39 
 
 		 7279 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  35.33 
 
 		 4607 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  33.03 
 
 		 3158 aa  475  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 3874 aa  476  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  33.1 
 
 		 2966 aa  475  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  32.38 
 
 		 2846 aa  476  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  33.45 
 
 		 1354 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  31.58 
 
 		 3508 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  35.54 
 
 		 2477 aa  476  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  32.42 
 
 		 2020 aa  477  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  31.94 
 
 		 1805 aa  476  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  33.42 
 
 		 3355 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  30.6 
 
 		 2126 aa  473  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  31.12 
 
 		 2890 aa  472  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  30.61 
 
 		 1827 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  30.86 
 
 		 7210 aa  473  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  30.35 
 
 		 2220 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  36.98 
 
 		 1143 aa  466  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.99 
 
 		 1337 aa  467  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  31.74 
 
 		 1587 aa  465  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  32.48 
 
 		 3449 aa  465  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  32.92 
 
 		 3252 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  30.76 
 
 		 3645 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.15 
 
 		 1909 aa  462  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  34.93 
 
 		 3427 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  31.43 
 
 		 4080 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 2551 aa  458  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  32.09 
 
 		 3493 aa  459  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  35.01 
 
 		 1584 aa  458  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  35.48 
 
 		 1114 aa  459  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>