More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0640 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  37.34 
 
 
2507 aa  661    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  41.77 
 
 
2476 aa  747    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  41.19 
 
 
2484 aa  721    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  39.06 
 
 
2460 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  40.1 
 
 
2556 aa  715    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  40.99 
 
 
2546 aa  714    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2352 aa  4637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  40.82 
 
 
2546 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  40.64 
 
 
2545 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  40.91 
 
 
2545 aa  722    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  37.42 
 
 
2523 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  39.24 
 
 
2543 aa  683    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  41.34 
 
 
2492 aa  741    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  38.6 
 
 
2543 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  41.37 
 
 
2468 aa  740    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  41.09 
 
 
2544 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  40.98 
 
 
2468 aa  728    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  37.44 
 
 
2547 aa  676    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  40.93 
 
 
2485 aa  752    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  33.79 
 
 
2500 aa  1122    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  37.68 
 
 
2499 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  41.09 
 
 
2544 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  40.99 
 
 
2546 aa  714    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  40.99 
 
 
2546 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  40.99 
 
 
2546 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  40.82 
 
 
2546 aa  709    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  40.99 
 
 
2546 aa  713    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  41.03 
 
 
2468 aa  731    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  39.56 
 
 
2492 aa  723    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  37.68 
 
 
2486 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  37.68 
 
 
2486 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.79 
 
 
1939 aa  596  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  32.74 
 
 
3111 aa  573  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.43 
 
 
1832 aa  568  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  34.72 
 
 
2232 aa  568  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  35.62 
 
 
3101 aa  566  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  33.83 
 
 
2333 aa  567  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.77 
 
 
1804 aa  562  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
1874 aa  563  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  35.12 
 
 
2230 aa  555  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
7110 aa  553  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.14 
 
 
3696 aa  546  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.49 
 
 
3676 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.03 
 
 
1656 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  36.73 
 
 
1144 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.88 
 
 
3702 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  35.7 
 
 
3930 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.68 
 
 
3693 aa  537  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.68 
 
 
3693 aa  537  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.3 
 
 
1822 aa  530  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  35.34 
 
 
3176 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.54 
 
 
1867 aa  530  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  34.75 
 
 
4151 aa  528  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  35.23 
 
 
3449 aa  524  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  35.98 
 
 
1587 aa  523  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.86 
 
 
3679 aa  516  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  35.08 
 
 
4183 aa  515  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 
7279 aa  511  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  33.88 
 
 
3080 aa  512  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.37 
 
 
2136 aa  512  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
3874 aa  513  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  33.17 
 
 
1827 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  35.05 
 
 
2966 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  33.24 
 
 
2462 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  29.44 
 
 
2551 aa  508  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  34.35 
 
 
2890 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.73 
 
 
1337 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  36.29 
 
 
3158 aa  505  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  33.52 
 
 
2126 aa  506  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  38.83 
 
 
1577 aa  505  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 
5154 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  34.62 
 
 
2719 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  39.5 
 
 
2666 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.96 
 
 
1087 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  38.93 
 
 
1581 aa  504  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  34.66 
 
 
3408 aa  499  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  34.64 
 
 
2090 aa  499  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  33.86 
 
 
2225 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  32.98 
 
 
1805 aa  498  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
2551 aa  497  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  36.42 
 
 
2880 aa  496  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  35.54 
 
 
5255 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.7 
 
 
1909 aa  496  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  32.7 
 
 
3508 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  32.23 
 
 
1966 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  36.94 
 
 
4607 aa  491  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  33.82 
 
 
6768 aa  493  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  39.28 
 
 
2846 aa  493  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  40.49 
 
 
1580 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  34.81 
 
 
2085 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  40.49 
 
 
1580 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  34.81 
 
 
2085 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  36.2 
 
 
1828 aa  493  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  34.84 
 
 
2085 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  34.7 
 
 
1831 aa  489  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.53 
 
 
4478 aa  490  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  35.09 
 
 
1823 aa  491  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  34.2 
 
 
2367 aa  490  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  40.29 
 
 
1580 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  36.13 
 
 
1704 aa  486  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>