More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1947 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06791  polyketide synthase, putative (JCVI)  27.46 
 
 		 2568 aa  690    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.489917  normal  0.163501 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  40.22 
 
 		 2507 aa  741    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  95.02 
 
 		 2468 aa  4465    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  40.76 
 
 		 2352 aa  714    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02547  polyketide synthase, putative (Eurofung)  28.38 
 
 		 2534 aa  717    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  38.64 
 
 		 2486 aa  707    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.62 
 
 		 1832 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.9 
 
 		 1939 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  42.75 
 
 		 2546 aa  778    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  39.47 
 
 		 2500 aa  1564    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  42.58 
 
 		 2546 aa  777    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  39.61 
 
 		 2556 aa  819    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  39.2 
 
 		 2545 aa  1285    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  42.67 
 
 		 2546 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  72.84 
 
 		 2476 aa  3386    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  52.81 
 
 		 2492 aa  2294    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  43.48 
 
 		 2544 aa  785    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  99.35 
 
 		 2468 aa  4861    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  75.18 
 
 		 2485 aa  3583    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2468 aa  4884    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  38.64 
 
 		 2486 aa  707    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  51.62 
 
 		 2492 aa  2244    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  41.96 
 
 		 2460 aa  891    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  39.56 
 
 		 2499 aa  748    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  43.48 
 
 		 2544 aa  785    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  72.27 
 
 		 2484 aa  3353    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  39.36 
 
 		 2545 aa  1283    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  39.6 
 
 		 2523 aa  1503    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  35.62 
 
 		 2543 aa  1228    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  42.67 
 
 		 2546 aa  778    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  34.15 
 
 		 2547 aa  1287    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  42.67 
 
 		 2546 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  42.67 
 
 		 2546 aa  779    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.07 
 
 		 1804 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  31.28 
 
 		 2333 aa  622  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  35 
 
 		 3101 aa  595  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 1874 aa  581  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  37.27 
 
 		 1144 aa  582  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  32.03 
 
 		 3111 aa  582  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  33.64 
 
 		 2232 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  34.49 
 
 		 2230 aa  567  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.89 
 
 		 1656 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.59 
 
 		 1909 aa  555  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  34.17 
 
 		 3176 aa  552  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  43.27 
 
 		 2543 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  34.04 
 
 		 2890 aa  545  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  33.75 
 
 		 3080 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  30.78 
 
 		 2551 aa  539  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  33.09 
 
 		 2225 aa  539  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.41 
 
 		 2136 aa  534  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  37.09 
 
 		 3099 aa  530  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  33.7 
 
 		 3693 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  32.7 
 
 		 2277 aa  528  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  33.7 
 
 		 3693 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  33.73 
 
 		 3676 aa  528  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  33.73 
 
 		 3702 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  33.39 
 
 		 1966 aa  525  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  42.87 
 
 		 2546 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.13 
 
 		 3679 aa  524  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.21 
 
 		 1087 aa  523  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  34.07 
 
 		 3463 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.63 
 
 		 1822 aa  520  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31 
 
 		 2462 aa  520  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.96 
 
 		 1337 aa  520  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  34.42 
 
 		 1587 aa  516  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  34.24 
 
 		 7279 aa  517  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  33.2 
 
 		 4151 aa  515  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 		 3874 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  34.43 
 
 		 3508 aa  516  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  37.8 
 
 		 2880 aa  511  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  32.11 
 
 		 2108 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  33.45 
 
 		 3494 aa  513  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  33.78 
 
 		 2719 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 		 5400 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.83 
 
 		 2762 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  32.15 
 
 		 1805 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.97 
 
 		 1867 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  33.91 
 
 		 7210 aa  506  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  34.46 
 
 		 2090 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  35.14 
 
 		 6768 aa  505  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  33.56 
 
 		 4183 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  34.28 
 
 		 3930 aa  507  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  34.24 
 
 		 3711 aa  502  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  35.15 
 
 		 3158 aa  502  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  34.15 
 
 		 1602 aa  504  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  33.42 
 
 		 3696 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  32.65 
 
 		 3645 aa  502  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  35.23 
 
 		 5255 aa  502  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 2551 aa  500  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  34.07 
 
 		 2604 aa  498  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  28.79 
 
 		 1349 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  34.06 
 
 		 3449 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  32.95 
 
 		 1827 aa  496  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.34 
 
 		 1372 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  38.83 
 
 		 1580 aa  496  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  28.62 
 
 		 1349 aa  496  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  38.83 
 
 		 1580 aa  496  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 7110 aa  496  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  38.88 
 
 		 1581 aa  496  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  35.16 
 
 		 1828 aa  496  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>