More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1945 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  43.21 
 
 		 2460 aa  926    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  39.13 
 
 		 2486 aa  719    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  38.83 
 
 		 1832 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  72.31 
 
 		 2468 aa  3340    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  39.13 
 
 		 2486 aa  719    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  39.01 
 
 		 2546 aa  1305    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  72.39 
 
 		 2468 aa  3356    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  39.99 
 
 		 2500 aa  1538    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  38.97 
 
 		 2546 aa  1303    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.62 
 
 		 1939 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  39.46 
 
 		 2545 aa  1308    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  30.25 
 
 		 2333 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  39.44 
 
 		 2543 aa  806    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  72.47 
 
 		 2468 aa  3345    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  70.95 
 
 		 2485 aa  3356    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  39.23 
 
 		 2523 aa  1492    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  43.82 
 
 		 2544 aa  799    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  39.17 
 
 		 2556 aa  821    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  41.53 
 
 		 2352 aa  724    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  53.29 
 
 		 2492 aa  2300    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  39.59 
 
 		 2544 aa  1319    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2484 aa  4892    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  37.49 
 
 		 2543 aa  1321    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  35.25 
 
 		 2547 aa  1333    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  51.75 
 
 		 2492 aa  2270    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  39.01 
 
 		 2546 aa  1305    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  37.53 
 
 		 2499 aa  1351    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  39.01 
 
 		 2546 aa  1305    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  38.97 
 
 		 2546 aa  1301    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  88.81 
 
 		 2476 aa  4219    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  39.01 
 
 		 2546 aa  1305    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  39.01 
 
 		 2546 aa  1305    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.54 
 
 		 1804 aa  662    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  41.25 
 
 		 2507 aa  743    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  44.37 
 
 		 2545 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  35.36 
 
 		 3101 aa  630  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  33.75 
 
 		 3111 aa  623  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  37.96 
 
 		 1144 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.25 
 
 		 1874 aa  595  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  34.21 
 
 		 2232 aa  595  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  35.21 
 
 		 2230 aa  595  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.49 
 
 		 1656 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.49 
 
 		 1909 aa  586  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  34.78 
 
 		 2890 aa  579  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  33.36 
 
 		 2225 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  34.42 
 
 		 3080 aa  575  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.39 
 
 		 3676 aa  576  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  35.34 
 
 		 3176 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.35 
 
 		 2136 aa  572  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  31.46 
 
 		 2551 aa  569  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  36.23 
 
 		 3449 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.52 
 
 		 3679 aa  566  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.49 
 
 		 3693 aa  567  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.49 
 
 		 3693 aa  567  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.49 
 
 		 3702 aa  566  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.11 
 
 		 1822 aa  563  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.62 
 
 		 2604 aa  555  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  32.57 
 
 		 2462 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  33.92 
 
 		 1087 aa  553  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  33.66 
 
 		 1827 aa  553  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  35.36 
 
 		 3508 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  35.5 
 
 		 3930 aa  549  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.33 
 
 		 1337 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  37.11 
 
 		 1828 aa  548  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  36.39 
 
 		 3408 aa  545  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  36.3 
 
 		 7279 aa  545  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  34.47 
 
 		 2277 aa  546  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  35.98 
 
 		 2762 aa  543  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  33.73 
 
 		 2108 aa  542  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  35.36 
 
 		 4183 aa  542  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  35.95 
 
 		 6768 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  33.05 
 
 		 1966 aa  541  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  34.97 
 
 		 1806 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 		 7110 aa  543  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  34.97 
 
 		 3696 aa  542  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.46 
 
 		 1867 aa  543  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  35.27 
 
 		 4151 aa  539  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.09 
 
 		 1349 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  32.18 
 
 		 1349 aa  540  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  35.69 
 
 		 2108 aa  539  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  33.47 
 
 		 1805 aa  540  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  36.91 
 
 		 1823 aa  535  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  35.64 
 
 		 2966 aa  535  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  34.81 
 
 		 3494 aa  535  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  34.92 
 
 		 3463 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  35.19 
 
 		 2719 aa  534  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.07 
 
 		 3645 aa  534  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.43 
 
 		 4478 aa  533  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  37.4 
 
 		 3099 aa  533  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  35.36 
 
 		 7210 aa  528  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  36.26 
 
 		 2126 aa  528  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  39.53 
 
 		 1577 aa  528  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  36.24 
 
 		 1876 aa  526  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  35.59 
 
 		 2090 aa  527  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  36.61 
 
 		 1835 aa  526  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 2085 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  35.04 
 
 		 4080 aa  523  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  33.42 
 
 		 2085 aa  523  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 3874 aa  522  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  33.42 
 
 		 2085 aa  523  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>