More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2723 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  38.51 
 
 
2486 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  38.57 
 
 
2545 aa  797    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  53.27 
 
 
2484 aa  2298    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  39.58 
 
 
2546 aa  795    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  39.65 
 
 
2546 aa  797    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  40.24 
 
 
2500 aa  1565    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  39.54 
 
 
2546 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  40.08 
 
 
2545 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  40.76 
 
 
2543 aa  816    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  52.85 
 
 
2492 aa  2373    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  38.64 
 
 
2544 aa  803    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  40.88 
 
 
2352 aa  711    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  52.61 
 
 
2468 aa  2270    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  53.27 
 
 
2476 aa  2304    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  29.03 
 
 
2551 aa  931    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2492 aa  4941    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.95 
 
 
1939 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  38.51 
 
 
2486 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  38.64 
 
 
2544 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  52.65 
 
 
2468 aa  2265    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  53.07 
 
 
2468 aa  2281    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  39.25 
 
 
2556 aa  843    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  41.08 
 
 
2460 aa  875    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  51.41 
 
 
2485 aa  2258    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  40.54 
 
 
2507 aa  724    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  39.41 
 
 
2523 aa  1495    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  35.74 
 
 
2547 aa  1296    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  39.65 
 
 
2546 aa  797    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  36.89 
 
 
2499 aa  1319    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  39.65 
 
 
2546 aa  797    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  39.65 
 
 
2546 aa  797    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  39.58 
 
 
2546 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  36.93 
 
 
2543 aa  1307    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.53 
 
 
1804 aa  619  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  29.24 
 
 
2333 aa  612  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.79 
 
 
1832 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  34.81 
 
 
2230 aa  605  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  33.02 
 
 
3111 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  35.64 
 
 
3101 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.66 
 
 
1656 aa  582  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.13 
 
 
3176 aa  570  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  34.3 
 
 
2232 aa  560  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  38.14 
 
 
1144 aa  556  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
1874 aa  552  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  33.27 
 
 
3080 aa  543  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.31 
 
 
7110 aa  538  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  35.75 
 
 
2762 aa  536  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  34.6 
 
 
1827 aa  536  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  34.87 
 
 
1587 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.52 
 
 
1087 aa  529  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.43 
 
 
1337 aa  530  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  33.03 
 
 
2225 aa  526  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  32.51 
 
 
3676 aa  525  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  33.61 
 
 
3696 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  34.64 
 
 
2890 aa  526  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.25 
 
 
1349 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  30.33 
 
 
1349 aa  523  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.29 
 
 
1822 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  32.66 
 
 
2108 aa  521  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  34.49 
 
 
3930 aa  519  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  32.39 
 
 
3693 aa  520  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 
1577 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  32.39 
 
 
3693 aa  520  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  32.41 
 
 
3702 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.72 
 
 
2551 aa  516  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.01 
 
 
3679 aa  516  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  36.88 
 
 
3099 aa  516  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  33.39 
 
 
4183 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.35 
 
 
1909 aa  512  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  38.55 
 
 
2880 aa  511  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.16 
 
 
2462 aa  513  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  37.99 
 
 
1581 aa  511  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  33.94 
 
 
4151 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  34.52 
 
 
7279 aa  509  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  33.94 
 
 
3449 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.31 
 
 
2136 aa  509  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  33.81 
 
 
2719 aa  506  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  39.8 
 
 
1580 aa  507  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.22 
 
 
4478 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  39.8 
 
 
1580 aa  507  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.43 
 
 
1867 aa  505  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  33.87 
 
 
7210 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
5400 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  34.99 
 
 
3670 aa  499  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  34.69 
 
 
2966 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.04 
 
 
1559 aa  500  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.19 
 
 
1372 aa  499  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  36.08 
 
 
1263 aa  499  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  36.55 
 
 
4607 aa  500  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  32.93 
 
 
1559 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  38.88 
 
 
1580 aa  501  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  32.55 
 
 
2277 aa  496  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  34.26 
 
 
3463 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  33.97 
 
 
3645 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  30.68 
 
 
2134 aa  495  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.8 
 
 
2604 aa  492  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  31.64 
 
 
1966 aa  494  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  38.67 
 
 
1828 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  34.36 
 
 
3508 aa  494  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  36.57 
 
 
1823 aa  492  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>