More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1113 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  49.9 
 
 		 2485 aa  2230    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  37.62 
 
 		 2545 aa  1276    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  51.9 
 
 		 2476 aa  2272    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  39.51 
 
 		 2486 aa  727    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  36.67 
 
 		 2546 aa  1275    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  35.32 
 
 		 2547 aa  1304    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  36.58 
 
 		 2546 aa  1271    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  40.1 
 
 		 2545 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  39.43 
 
 		 2543 aa  804    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  35.78 
 
 		 2556 aa  792    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  51.64 
 
 		 2468 aa  2223    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  37.25 
 
 		 2544 aa  1274    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2492 aa  5032    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  38.57 
 
 		 2523 aa  915    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  52.57 
 
 		 2492 aa  2333    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  39.51 
 
 		 2486 aa  727    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  36.58 
 
 		 2546 aa  1275    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  51.5 
 
 		 2468 aa  2210    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  38.42 
 
 		 2507 aa  689    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  38.68 
 
 		 2500 aa  1523    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  37.25 
 
 		 2544 aa  1276    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  39.19 
 
 		 2352 aa  694    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  36.25 
 
 		 2543 aa  1281    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  51.63 
 
 		 2484 aa  2243    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  41.34 
 
 		 2460 aa  836    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  36.76 
 
 		 2499 aa  1321    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  51.44 
 
 		 2468 aa  2216    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  36.58 
 
 		 2546 aa  1275    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  36.58 
 
 		 2546 aa  1275    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  36.55 
 
 		 2546 aa  1268    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  36.58 
 
 		 2546 aa  1271    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.18 
 
 		 1939 aa  633  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.16 
 
 		 1804 aa  631  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  28.7 
 
 		 2333 aa  600  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.84 
 
 		 1832 aa  600  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  33.69 
 
 		 3080 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  33.81 
 
 		 3101 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.8 
 
 		 3111 aa  572  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  34.02 
 
 		 2232 aa  568  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  32.81 
 
 		 2230 aa  567  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 		 7110 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  36.41 
 
 		 1144 aa  540  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  34.09 
 
 		 3176 aa  536  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 1874 aa  533  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.39 
 
 		 1656 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  33.68 
 
 		 2890 aa  533  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.95 
 
 		 4478 aa  533  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  34.3 
 
 		 2277 aa  531  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.29 
 
 		 3676 aa  530  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  34.1 
 
 		 2225 aa  525  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 3693 aa  527  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 3693 aa  527  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  33.25 
 
 		 3702 aa  527  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.48 
 
 		 3679 aa  522  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.33 
 
 		 1909 aa  516  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.31 
 
 		 2136 aa  517  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  34.64 
 
 		 3449 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.72 
 
 		 1822 aa  513  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  33.36 
 
 		 7210 aa  510  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.97 
 
 		 1337 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  33.22 
 
 		 4151 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  30.23 
 
 		 2551 aa  508  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  34.01 
 
 		 3930 aa  510  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  34.79 
 
 		 3508 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  34.97 
 
 		 2846 aa  506  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  33.57 
 
 		 2719 aa  506  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  36.84 
 
 		 1577 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.93 
 
 		 2762 aa  506  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.96 
 
 		 1867 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  33.8 
 
 		 4183 aa  506  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 3874 aa  506  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.56 
 
 		 1349 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  39.66 
 
 		 1580 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  39.66 
 
 		 1580 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  33.71 
 
 		 3670 aa  503  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  33.73 
 
 		 3158 aa  500  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.7 
 
 		 1087 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  34.27 
 
 		 1587 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 		 5400 aa  499  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  39.22 
 
 		 1580 aa  496  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  34.7 
 
 		 3463 aa  496  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  33.51 
 
 		 2126 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  33.65 
 
 		 1602 aa  497  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  30.42 
 
 		 1349 aa  497  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  34.22 
 
 		 3696 aa  496  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  32.61 
 
 		 2085 aa  493  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.82 
 
 		 7279 aa  492  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  34.41 
 
 		 6768 aa  492  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  32.46 
 
 		 1827 aa  494  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  33.54 
 
 		 2085 aa  493  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  33.54 
 
 		 2085 aa  493  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  33.3 
 
 		 2966 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  34.71 
 
 		 4930 aa  489  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 		 3645 aa  489  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  36.22 
 
 		 2880 aa  485  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  33.6 
 
 		 3252 aa  487  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  32.39 
 
 		 2108 aa  486  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  34.64 
 
 		 4575 aa  487  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  36.84 
 
 		 1581 aa  486  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  33.25 
 
 		 4080 aa  487  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>