More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4330 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  33.35 
 
 		 2499 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  38.44 
 
 		 2460 aa  806    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  36.37 
 
 		 2546 aa  1221    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  100 
 
 		 2523 aa  5064    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  36.3 
 
 		 2546 aa  1216    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  36.69 
 
 		 2556 aa  1283    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  39.6 
 
 		 2485 aa  1465    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  39.98 
 
 		 2468 aa  1447    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  36.84 
 
 		 2543 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  37.46 
 
 		 2507 aa  683    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  35.77 
 
 		 2547 aa  665    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  38.39 
 
 		 2492 aa  887    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  39.43 
 
 		 2468 aa  1422    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 		 2476 aa  1479    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  37.13 
 
 		 2544 aa  1240    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  39.49 
 
 		 2484 aa  1424    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  37.06 
 
 		 2545 aa  1244    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  57.44 
 
 		 2500 aa  2743    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  36.34 
 
 		 2546 aa  1220    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  36.34 
 
 		 2546 aa  1220    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  36.34 
 
 		 2546 aa  1220    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  36.31 
 
 		 2546 aa  1221    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  39.3 
 
 		 2492 aa  1449    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  39.43 
 
 		 2468 aa  1428    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  36.37 
 
 		 2546 aa  1221    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  36.91 
 
 		 2352 aa  619  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  34.12 
 
 		 2486 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  34.12 
 
 		 2486 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.89 
 
 		 1804 aa  582  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.93 
 
 		 1939 aa  571  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  42.36 
 
 		 2543 aa  571  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  41.05 
 
 		 2545 aa  549  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  32.2 
 
 		 3111 aa  547  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  33.22 
 
 		 2333 aa  545  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  41.92 
 
 		 2544 aa  540  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.94 
 
 		 1822 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  26.66 
 
 		 2551 aa  523  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 		 3693 aa  519  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 		 3693 aa  519  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  31.34 
 
 		 2230 aa  520  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 		 3702 aa  520  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.39 
 
 		 1656 aa  515  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  32.45 
 
 		 3080 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.69 
 
 		 2462 aa  512  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  32.96 
 
 		 3676 aa  511  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 		 7110 aa  513  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  31.87 
 
 		 2232 aa  509  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  31.74 
 
 		 1832 aa  510  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  34.63 
 
 		 3930 aa  509  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.79 
 
 		 1867 aa  509  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  32.8 
 
 		 2126 aa  506  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 		 1874 aa  501  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.39 
 
 		 3679 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  32.21 
 
 		 3176 aa  502  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  33.41 
 
 		 1144 aa  500  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  33.97 
 
 		 1354 aa  499  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  32.71 
 
 		 3101 aa  496  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  34.1 
 
 		 4151 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  33.66 
 
 		 1602 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  33.09 
 
 		 7210 aa  497  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 5400 aa  491  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.26 
 
 		 2762 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.42 
 
 		 7279 aa  489  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  36.04 
 
 		 1114 aa  487  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  35.94 
 
 		 2880 aa  487  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  33.96 
 
 		 3449 aa  484  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  31.31 
 
 		 1087 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  31.11 
 
 		 2085 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  31.11 
 
 		 2085 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.15 
 
 		 1101 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  31.11 
 
 		 2085 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.19 
 
 		 4478 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  32.07 
 
 		 3696 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  32.87 
 
 		 2225 aa  476  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  31.9 
 
 		 3508 aa  476  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  38.14 
 
 		 3254 aa  477  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  34.29 
 
 		 3711 aa  475  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  31.98 
 
 		 2277 aa  473  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  33.42 
 
 		 4080 aa  473  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  31.52 
 
 		 4183 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  33.07 
 
 		 3408 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  33.64 
 
 		 2604 aa  470  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  33.15 
 
 		 5255 aa  470  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.04 
 
 		 1909 aa  470  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  33.94 
 
 		 3355 aa  469  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  34.05 
 
 		 6768 aa  466  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 5154 aa  465  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  33.04 
 
 		 2719 aa  468  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 		 3874 aa  466  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 2551 aa  466  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  33.87 
 
 		 2846 aa  466  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  33.84 
 
 		 3463 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  34.05 
 
 		 4607 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  33.94 
 
 		 3158 aa  464  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.36 
 
 		 1337 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  31.69 
 
 		 2108 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  37.04 
 
 		 3281 aa  464  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  32.87 
 
 		 2020 aa  463  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  34.13 
 
 		 3099 aa  462  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  35.25 
 
 		 1548 aa  459  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>