More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5387 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
329 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  86.02 
 
 
329 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  85.41 
 
 
329 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  85.41 
 
 
329 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  86.02 
 
 
329 aa  550  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  65.96 
 
 
330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  57.45 
 
 
329 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.84 
 
 
329 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  56.53 
 
 
360 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  53.5 
 
 
329 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  54.71 
 
 
329 aa  360  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.41 
 
 
329 aa  350  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  52.28 
 
 
330 aa  349  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  52.58 
 
 
328 aa  348  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.8 
 
 
329 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
333 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  45.26 
 
 
337 aa  300  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.58 
 
 
332 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.11 
 
 
338 aa  279  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3549  alcohol dehydrogenase  97.79 
 
 
136 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.43 
 
 
337 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.85 
 
 
326 aa  235  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 
323 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.07 
 
 
326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.42 
 
 
331 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32420  putative oxidoreductase  36.5 
 
 
339 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366639  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2747  putative oxidoreductase  35.91 
 
 
339 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  34.72 
 
 
340 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2184  alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 
340 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.742883  normal  0.0144783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2977  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
340 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0293336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2827  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.03 
 
 
340 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2862  alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
340 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2955  alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574608  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2667  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.15 
 
 
340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  38.67 
 
 
326 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2912  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.23 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823594  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.4 
 
 
340 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.324261  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6434  alcohol dehydrogenase  79.81 
 
 
235 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.461094  normal  0.186304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.55 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.03 
 
 
326 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.54 
 
 
324 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  35.95 
 
 
324 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.67 
 
 
328 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
332 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.26 
 
 
332 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
333 aa  155  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
325 aa  155  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.84 
 
 
336 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
326 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
339 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
332 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
326 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 
326 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.12 
 
 
326 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  33.94 
 
 
349 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.23 
 
 
342 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 
326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.55 
 
 
326 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
325 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.22 
 
 
324 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.54 
 
 
332 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.64 
 
 
326 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.23 
 
 
336 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
329 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
332 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  34.04 
 
 
332 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.85 
 
 
342 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  33.23 
 
 
336 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  33.23 
 
 
336 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
333 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
322 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.35 
 
 
314 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.73 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.63 
 
 
327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.63 
 
 
328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.24 
 
 
328 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  32.32 
 
 
328 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 
335 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.15 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.56 
 
 
342 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.33 
 
 
335 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
324 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.02 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6167  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.95 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224463  normal  0.398183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.38 
 
 
322 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>