More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3549 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3549  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
136 aa  271  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  97.79 
 
 
329 aa  268  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  91.18 
 
 
329 aa  249  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  90.44 
 
 
329 aa  249  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  90.44 
 
 
329 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  90.44 
 
 
329 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  59.56 
 
 
330 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  49.26 
 
 
360 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  52.71 
 
 
329 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.74 
 
 
329 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  46.32 
 
 
329 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.32 
 
 
329 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.06 
 
 
329 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  52.14 
 
 
328 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  44.12 
 
 
330 aa  123  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  42.65 
 
 
329 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  44.85 
 
 
333 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0629  hypothetical protein  48.36 
 
 
124 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  41.79 
 
 
337 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.17 
 
 
332 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0799  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  65.75 
 
 
74 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.41 
 
 
326 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0465  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3238  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0216  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2804  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849843  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1377  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.17 
 
 
331 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.96 
 
 
337 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.17 
 
 
326 aa  87.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0445  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.85 
 
 
338 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2747  putative oxidoreductase  32.12 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32420  putative oxidoreductase  31.39 
 
 
339 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366639  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18893  predicted protein  30.23 
 
 
363 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.82 
 
 
334 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.07 
 
 
342 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
335 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6167  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.94 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224463  normal  0.398183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5626  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
326 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.20358  normal  0.110388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 
323 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.06 
 
 
331 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
333 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.35 
 
 
332 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 
334 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.08 
 
 
333 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.01 
 
 
331 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.78 
 
 
336 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.01 
 
 
335 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  30.47 
 
 
331 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  30.47 
 
 
331 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3808  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
323 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
335 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.47 
 
 
331 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.09 
 
 
323 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  30.66 
 
 
340 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0501  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.96 
 
 
332 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
325 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
339 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 
323 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0913  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.48 
 
 
328 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0131994 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  32.28 
 
 
324 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1832  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.09 
 
 
331 aa  60.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.612852  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2977  alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
340 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0293336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.3 
 
 
335 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  32.52 
 
 
349 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4852  putative Zinc-dependent dehydrogenase  31.69 
 
 
336 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249579  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.69 
 
 
331 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.11 
 
 
335 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.77 
 
 
334 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.11 
 
 
335 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.11 
 
 
335 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.11 
 
 
378 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  32.28 
 
 
324 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.11 
 
 
335 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6325  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.26 
 
 
376 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229164  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.43 
 
 
326 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3022  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
328 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0720259  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.11 
 
 
405 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.22 
 
 
335 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.11 
 
 
405 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5714  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.39 
 
 
340 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
335 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30 
 
 
335 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2184  alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
340 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.742883  normal  0.0144783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.92 
 
 
338 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
324 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.11 
 
 
388 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3749  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
325 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3065  alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 
325 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578472  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07084  PKS-like enzyme, putative (JCVI)  28.23 
 
 
2388 aa  57  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.623397  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
339 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
335 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3737  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
325 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.392288  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 
332 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.83 
 
 
334 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
326 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
326 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>