74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0465 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0465  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2804  hypothetical protein  97.78 
 
 
90 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3238  hypothetical protein  97.78 
 
 
90 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1377  hypothetical protein  97.78 
 
 
90 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0216  hypothetical protein  97.78 
 
 
90 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0629  hypothetical protein  96.67 
 
 
124 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0445  hypothetical protein  95.56 
 
 
90 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  90 
 
 
329 aa  164  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.56 
 
 
329 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.22 
 
 
329 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  52.22 
 
 
328 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
329 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
329 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
329 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
329 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  46.67 
 
 
330 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  47.73 
 
 
329 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3549  alcohol dehydrogenase  47.73 
 
 
136 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.73 
 
 
329 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  51.14 
 
 
330 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  47.13 
 
 
360 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.98 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0799  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.52 
 
 
74 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  45.45 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  41.38 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  39.08 
 
 
329 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.78 
 
 
332 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.47 
 
 
338 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
333 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
323 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.89 
 
 
326 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.08 
 
 
326 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.02 
 
 
337 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
334 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
329 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.23 
 
 
336 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.88 
 
 
337 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5041  alcohol dehydrogenase  43.18 
 
 
323 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750804  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  32.97 
 
 
328 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
325 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0286  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.43 
 
 
316 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2635  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.58 
 
 
322 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0913  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.82 
 
 
328 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0131994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
339 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.94 
 
 
334 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  38.96 
 
 
335 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
344 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
339 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2747  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
339 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
332 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
332 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
335 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
314 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.17 
 
 
328 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0180  alcohol dehydrogenase  36.96 
 
 
329 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.089146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0128  quinone oxidoreductase putative, PIG3  31.58 
 
 
331 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180561  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32420  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
339 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366639  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0336  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.14 
 
 
328 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  0.594671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.89 
 
 
322 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.88 
 
 
334 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
336 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
336 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  48.72 
 
 
332 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0192  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.56 
 
 
323 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.59 
 
 
336 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  29.76 
 
 
340 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.61 
 
 
332 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
335 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 
335 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.77 
 
 
332 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.18 
 
 
336 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0221  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.07 
 
 
302 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569438  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.03 
 
 
323 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  33.87 
 
 
302 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>