More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0629 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0629  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  243  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  89.52 
 
 
329 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3238  hypothetical protein  98.89 
 
 
90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1377  hypothetical protein  98.89 
 
 
90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0216  hypothetical protein  98.89 
 
 
90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2804  hypothetical protein  98.89 
 
 
90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849843  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0465  hypothetical protein  96.67 
 
 
90 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0445  hypothetical protein  96.67 
 
 
90 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.55 
 
 
329 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  49.19 
 
 
330 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.55 
 
 
329 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  51.24 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  52.59 
 
 
328 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
329 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
329 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
329 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  48.36 
 
 
329 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3549  alcohol dehydrogenase  48.36 
 
 
136 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  49.19 
 
 
360 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.54 
 
 
329 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.58 
 
 
329 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  49.59 
 
 
330 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  44.35 
 
 
329 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  41.8 
 
 
337 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  41.32 
 
 
333 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0799  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.11 
 
 
74 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.67 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.13 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.17 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.66 
 
 
337 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  35.25 
 
 
328 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
333 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0128  quinone oxidoreductase putative, PIG3  36.11 
 
 
331 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180561  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.97 
 
 
326 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 
325 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
334 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.87 
 
 
337 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.13 
 
 
332 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
332 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
332 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.6 
 
 
329 aa  60.1  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.71 
 
 
331 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0286  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.54 
 
 
316 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
329 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.84 
 
 
336 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.43 
 
 
335 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  31.75 
 
 
332 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.54 
 
 
332 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
332 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.06 
 
 
334 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
332 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2747  putative oxidoreductase  28.79 
 
 
339 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0913  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.46 
 
 
328 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0131994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32420  putative oxidoreductase  28.79 
 
 
339 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366639  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18893  predicted protein  30.51 
 
 
363 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6140  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.68 
 
 
328 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.57 
 
 
342 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.98 
 
 
328 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
332 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 
327 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
339 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.16 
 
 
335 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.97 
 
 
324 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 
335 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0832  alcohol dehydrogenase  26.98 
 
 
328 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000430219  normal  0.313635 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  29.84 
 
 
336 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0180  alcohol dehydrogenase  26.19 
 
 
329 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.089146  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.84 
 
 
336 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  29.84 
 
 
336 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.89 
 
 
336 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  28.81 
 
 
340 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.33 
 
 
334 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2667  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.51 
 
 
340 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.71 
 
 
339 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 
336 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0336  quinone oxidoreductase putative PIG3  32 
 
 
328 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  0.594671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.05 
 
 
339 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4852  putative Zinc-dependent dehydrogenase  28.57 
 
 
336 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249579  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 
336 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.75 
 
 
325 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3455  alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
325 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  29.75 
 
 
328 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2977  alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
340 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0293336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2955  alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
340 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574608  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.15 
 
 
327 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
339 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
339 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4322  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
316 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
339 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.2 
 
 
332 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.2 
 
 
338 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 
344 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 
336 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.03 
 
 
335 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1088  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.35 
 
 
328 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 
339 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.54 
 
 
317 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0192  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.41 
 
 
323 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
339 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>