More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2636 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
326 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  86.81 
 
 
326 aa  541  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 
325 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.58 
 
 
323 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.7 
 
 
333 aa  224  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  35.19 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  38.84 
 
 
330 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.48 
 
 
331 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.72 
 
 
331 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  38.72 
 
 
331 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  37.91 
 
 
330 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  38.23 
 
 
330 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  38.65 
 
 
330 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.42 
 
 
325 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.8 
 
 
331 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
330 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  37.89 
 
 
323 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.73 
 
 
330 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.89 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.47 
 
 
344 aa  192  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.05 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.18 
 
 
338 aa  179  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.08 
 
 
327 aa  179  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
324 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.74 
 
 
323 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
323 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.44 
 
 
323 aa  158  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.78 
 
 
323 aa  156  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.16 
 
 
322 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.95 
 
 
324 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.92 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 
326 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
329 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
324 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0316  alcohol dehydrogenase  36.79 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.86 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  32.23 
 
 
331 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34892  mitochondrial trans-2-enoyl-CoA reductase 2  29.12 
 
 
366 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537322  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  34.24 
 
 
322 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
322 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.77 
 
 
321 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  29.85 
 
 
325 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 
329 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
326 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  32.9 
 
 
327 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.9 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.52 
 
 
326 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.53 
 
 
329 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03606  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  40 
 
 
196 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  32.63 
 
 
349 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  31.6 
 
 
326 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.82 
 
 
324 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.21 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09401  mitochondrial enoyl reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04150)  30.74 
 
 
422 aa  135  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166107  normal  0.058667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.23 
 
 
329 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.79 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
323 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30 
 
 
328 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
324 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  31.4 
 
 
329 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  30.15 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
322 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.95 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  31.6 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
337 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
324 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.91 
 
 
322 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.65 
 
 
337 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.52 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1096  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.9 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.39 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.9 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.28 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  31.69 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  30.28 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  32.59 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.71 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.19 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  29.54 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
329 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.45 
 
 
328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.84 
 
 
324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>