More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3905 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
327 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  39.39 
 
 
326 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
326 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.56 
 
 
323 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
325 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.8 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.53 
 
 
330 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.53 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  33.13 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
330 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.93 
 
 
331 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  33.03 
 
 
330 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.83 
 
 
331 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.63 
 
 
330 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.42 
 
 
324 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  34.53 
 
 
323 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
325 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 
325 aa  155  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  30.42 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.44 
 
 
322 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.84 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.76 
 
 
338 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
324 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.83 
 
 
327 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  32.52 
 
 
331 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
326 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.85 
 
 
326 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
327 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.98 
 
 
322 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.73 
 
 
337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.54 
 
 
329 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  33.74 
 
 
329 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.51 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.96 
 
 
327 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
329 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  32.9 
 
 
338 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  28.67 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1025  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.73 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0042079  normal  0.442339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.23 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  32.18 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
330 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  31 
 
 
329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.85 
 
 
323 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.1 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.76 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0129924  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2276  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.44 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000917722  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1640  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00037111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2252  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0476734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.48 
 
 
332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 
333 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
329 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.12 
 
 
332 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
326 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
326 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.8 
 
 
339 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.01 
 
 
323 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.77 
 
 
330 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
324 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
329 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
339 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
329 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31 
 
 
329 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
332 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  34.46 
 
 
325 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.82 
 
 
328 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.19 
 
 
337 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.88 
 
 
344 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
334 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
328 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.6 
 
 
324 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.44 
 
 
324 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 
324 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 
326 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.18 
 
 
324 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.21 
 
 
323 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.12 
 
 
329 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 
324 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  25.89 
 
 
326 aa  122  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.82 
 
 
322 aa  122  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.4 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.85 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.84 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.72 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
324 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
324 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 
325 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.94 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.16 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>