More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1173 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
327 aa  659    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  73.39 
 
 
327 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.37 
 
 
325 aa  281  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  43.21 
 
 
325 aa  277  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.28 
 
 
325 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
325 aa  259  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.82 
 
 
331 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.2 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03606  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  45.92 
 
 
196 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
326 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  31.95 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.12 
 
 
344 aa  142  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
324 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
327 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 
330 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  27.79 
 
 
330 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.47 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.47 
 
 
331 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  27.47 
 
 
331 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.16 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  27.96 
 
 
330 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.18 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  27.18 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.54 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 
325 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.54 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.54 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  27.38 
 
 
337 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  26.4 
 
 
330 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29 
 
 
324 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.56 
 
 
333 aa  105  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.62 
 
 
322 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.3 
 
 
326 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.42 
 
 
327 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1909  alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
309 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  25.38 
 
 
326 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0316  alcohol dehydrogenase  28.42 
 
 
321 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.76 
 
 
323 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
329 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
329 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
329 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.69 
 
 
326 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0757  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
334 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1238  alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
334 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45262  predicted protein  29.82 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235786  normal  0.755284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0501  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.8 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1211  alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.33 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
322 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.87 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  30.74 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.46 
 
 
325 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03605  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  41.74 
 
 
117 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.416755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.83 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  26.75 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  25.55 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  26.15 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.25 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.92 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
321 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.93 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.28 
 
 
327 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.47 
 
 
322 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  27.44 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.82 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.06 
 
 
322 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.06 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  24.77 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  31.38 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  26.82 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.93 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  25.85 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0529  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  26.3 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  30.89 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1471  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.96 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  31.12 
 
 
324 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.79 
 
 
343 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2724  alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.69 
 
 
326 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.81 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.38 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  26.21 
 
 
331 aa  89.7  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2517  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.71 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0419474  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.94 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3686  alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 
331 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343623  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.55 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2497  alcohol dehydrogenase  29.54 
 
 
368 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0063447  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  27.52 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.82 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>