More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1471 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1471  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 334 aa  662    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00158  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11430)  37.23 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  36.71 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  36 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1674  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568438  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  36.96 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.23 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  44.73 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.27 
 
 		 325 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  34.81 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.24 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.23 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  35.19 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  35.1 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 		 325 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.71 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.31 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  34.6 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.8 
 
 		 328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  38.87 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  37.5 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.79 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  38.1 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  34.19 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  34.7 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.97 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  38.92 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.25 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  36.39 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.72 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1147  alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.26 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.31 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.69 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4023  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.961336  unclonable  0.000000000225765 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0501  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.24 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2009  alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0757  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1238  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.31 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.9 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.92 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.7 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03835  predicted NADP-dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0444273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.82 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.92 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.89 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.14 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3470  alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  39.08 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.96 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  34.98 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.93 
 
 		 326 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.92 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3496  quinone oxidoreductase  35.37 
 
 		 321 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 		 322 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.73 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  31.14 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.72 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1211  alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 		 334 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.24 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  39.91 
 
 		 389 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>