More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0497 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
322 aa  634    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.19 
 
 
322 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.56 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
326 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.28 
 
 
330 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.28 
 
 
331 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  34.66 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  34.84 
 
 
323 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.18 
 
 
330 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 
330 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.37 
 
 
324 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  38.43 
 
 
330 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  38.38 
 
 
327 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.36 
 
 
331 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 
331 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.91 
 
 
323 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  34.24 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.78 
 
 
331 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
325 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.9 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1909  alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
309 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  28.01 
 
 
325 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.33 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  29.5 
 
 
327 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
330 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001036  hypothetical protein  29.82 
 
 
330 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.78 
 
 
338 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.95 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.55 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
329 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.38 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  31.42 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  31.86 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.74 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.36 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.13 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.13 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
325 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  27.69 
 
 
342 aa  89  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1096  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.21 
 
 
317 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
326 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1920  putative quinone oxidoreductase  31.27 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1221  putative quinone oxidoreductase  31.27 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.908544  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1683  quinone oxidoreductase, putative  31.27 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0232  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.27 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  29.43 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.76 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.27 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2197  putative quinone oxidoreductase  31.27 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51788  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0935  putative quinone oxidoreductase  31.27 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.65 
 
 
322 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0322  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.97 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.72 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.83 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
329 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.8 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4811  predicted protein  34.82 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0238831 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  29.43 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.61 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3064  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.74 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  28.36 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3496  quinone oxidoreductase  28.4 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.73 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.02 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.61 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  30.75 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3193  alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  28.83 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  24.92 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  29.43 
 
 
324 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.76 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.36 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  25 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.57 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03606  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1400  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  25.7 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.51 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>