More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3191 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 325 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  43.31 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  43.45 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  38.34 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.02 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.2 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.1 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.31 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.31 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  31.95 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.01 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09401  mitochondrial enoyl reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04150)  33.24 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166107  normal  0.058667 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  32.59 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  33.01 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.59 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.59 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  32.28 
 
 		 330 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.75 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34892  mitochondrial trans-2-enoyl-CoA reductase 2  31.56 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45262  predicted protein  35.24 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235786  normal  0.755284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.65 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.28 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.72 
 
 		 324 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.05 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.86 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03606  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  41.01 
 
 		 196 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.29 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0316  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0232  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.97 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1920  putative quinone oxidoreductase  33.97 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1683  quinone oxidoreductase, putative  33.97 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0935  putative quinone oxidoreductase  33.97 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1221  putative quinone oxidoreductase  33.97 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.908544  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2197  putative quinone oxidoreductase  33.97 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  34.29 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0322  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.65 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.77 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53084  mitochondrial 2-enoyl thioester reductase  29.94 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.752988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1928  alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00329815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.18 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  28.8 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.31 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.19 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  31.35 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.79 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5714  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.53 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  31.63 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4811  predicted protein  34.84 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10497  predicted protein  32.36 
 
 		 275 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  33.12 
 
 		 319 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2497  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0063447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  28.8 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.09 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  29.23 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.6 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.57 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.48 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  28.71 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.71 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.17 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0501  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.02 
 
 		 332 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.19 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.51 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.94 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  28.08 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  27.76 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.93 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>