More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0017 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
325 aa  653    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.12 
 
 
325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  62.04 
 
 
325 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.73 
 
 
325 aa  398  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.48 
 
 
331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
327 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.74 
 
 
327 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03606  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  57.14 
 
 
196 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.2 
 
 
323 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
325 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
326 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
327 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
324 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  31.14 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  31.08 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.2 
 
 
344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 
330 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.49 
 
 
330 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 
330 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  30.4 
 
 
330 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.82 
 
 
330 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.42 
 
 
333 aa  143  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.85 
 
 
326 aa  142  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.88 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.42 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.66 
 
 
324 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 
342 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.75 
 
 
326 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.72 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  28.75 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.67 
 
 
324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  32.13 
 
 
322 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 
329 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
322 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.31 
 
 
324 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0501  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.29 
 
 
332 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.51 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.14 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.28 
 
 
329 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.06 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
325 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.08 
 
 
322 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.17 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.44 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  28.36 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0630  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.4 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0529  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.71 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09401  mitochondrial enoyl reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04150)  28.49 
 
 
422 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166107  normal  0.058667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  27.96 
 
 
322 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3496  quinone oxidoreductase  28.22 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1766  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.61 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0377504  normal  0.772625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.28 
 
 
323 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.87 
 
 
338 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
329 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
329 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
329 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.84 
 
 
328 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11482  quinone reductase qor (NADPH:quinone reductase) (zeta-crystallin protein)  33.2 
 
 
328 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000201943  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3512  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.53 
 
 
321 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  28.69 
 
 
327 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  30.24 
 
 
326 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
322 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.33 
 
 
329 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45262  predicted protein  28.77 
 
 
372 aa  106  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235786  normal  0.755284 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0385  quinone oxidoreductase  26.4 
 
 
324 aa  106  4e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.930589  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.47 
 
 
324 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.05 
 
 
327 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  27.27 
 
 
328 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1909  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
309 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.97 
 
 
328 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.84 
 
 
319 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
329 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  27.27 
 
 
328 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3286  quinone oxidoreductase  28.83 
 
 
321 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.635243  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4086  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.4 
 
 
325 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  27.27 
 
 
328 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3544  quinone oxidoreductase  28.83 
 
 
321 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.752673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03605  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  41.59 
 
 
117 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.416755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3483  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.49 
 
 
321 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.265979  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  26.67 
 
 
328 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.05 
 
 
331 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.35 
 
 
325 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 
328 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
324 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2359  alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 
351 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2497  alcohol dehydrogenase  27.13 
 
 
368 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0063447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>