More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2753 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
331 aa  659    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.19 
 
 
325 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.64 
 
 
325 aa  333  3e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  48.64 
 
 
325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.85 
 
 
327 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 
327 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03606  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  57.65 
 
 
196 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.95 
 
 
323 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 
326 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
325 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  37.58 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
327 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.92 
 
 
333 aa  145  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  29.85 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.3 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  30.19 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 
330 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
330 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  29.91 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.43 
 
 
330 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.7 
 
 
331 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.55 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
322 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
323 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
337 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.63 
 
 
324 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0501  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.16 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.82 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.91 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
326 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.23 
 
 
322 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.79 
 
 
323 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
331 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.82 
 
 
338 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.16 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.79 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  27.19 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.41 
 
 
322 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 
335 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
324 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.12 
 
 
329 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  28.82 
 
 
329 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.82 
 
 
329 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  28.82 
 
 
329 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
325 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
324 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  28.44 
 
 
319 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 
328 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 
326 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 
322 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  28.09 
 
 
348 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
330 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
321 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.78 
 
 
322 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
326 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.44 
 
 
324 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
325 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  27.13 
 
 
325 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.91 
 
 
322 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.36 
 
 
327 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.2 
 
 
324 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1211  alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
334 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1928  alcohol dehydrogenase  25.66 
 
 
337 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00329815  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34892  mitochondrial trans-2-enoyl-CoA reductase 2  28.48 
 
 
366 aa  101  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537322  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0630  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.27 
 
 
324 aa  100  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45262  predicted protein  30.41 
 
 
372 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235786  normal  0.755284 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0529  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
325 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.23 
 
 
324 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.27 
 
 
329 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  26.01 
 
 
326 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
329 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  26.39 
 
 
325 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
342 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.29 
 
 
328 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  29.28 
 
 
329 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  30.43 
 
 
327 aa  99.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0757  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
334 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1238  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
334 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
322 aa  99.8  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.5 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.92 
 
 
328 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 
332 aa  99.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
329 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
324 aa  99.4  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.62 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2497  alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
368 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0063447  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  29.06 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  26.19 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  27.96 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.18 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.25 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>