More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0196 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  100 
 
 
322 aa  640    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0529  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.7 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  45.51 
 
 
328 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  44.27 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.27 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.27 
 
 
328 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.58 
 
 
328 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  44.27 
 
 
328 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  44.58 
 
 
328 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  44.58 
 
 
328 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  43.52 
 
 
328 aa  275  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.17 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.23 
 
 
324 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.64 
 
 
335 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.38 
 
 
324 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.14 
 
 
318 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1096  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.31 
 
 
317 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  38.89 
 
 
321 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.2 
 
 
322 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  40.12 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.32 
 
 
323 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
322 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.77 
 
 
321 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
323 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.02 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0500  alcohol dehydrogenase  40.37 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.08 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.44 
 
 
321 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 
335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.94 
 
 
324 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.27 
 
 
321 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.31 
 
 
327 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.72 
 
 
320 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  39.3 
 
 
325 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.08 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  37.84 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  37.46 
 
 
322 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.15 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2916  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.35 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.31 
 
 
326 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  38.25 
 
 
326 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 
329 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 
322 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1766  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.8 
 
 
321 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0377504  normal  0.772625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
321 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.92 
 
 
324 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  36.69 
 
 
324 aa  175  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3512  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.49 
 
 
321 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  37.65 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.62 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  38.15 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.41 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  36 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.38 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.17 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.61 
 
 
327 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 
326 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3496  quinone oxidoreductase  35.49 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.64 
 
 
327 aa  172  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.34 
 
 
324 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.46 
 
 
317 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0480145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 
339 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  32 
 
 
324 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.81 
 
 
327 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
327 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
324 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  37.16 
 
 
327 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  36.47 
 
 
320 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  38.27 
 
 
323 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  36.81 
 
 
324 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  35.89 
 
 
323 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
325 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  38.82 
 
 
325 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1673  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.81 
 
 
316 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.28 
 
 
331 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
329 aa  168  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
319 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  37.35 
 
 
327 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3483  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.76 
 
 
321 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.265979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.94 
 
 
334 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
328 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  39.21 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0757  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1238  alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  36.64 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  38.48 
 
 
325 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.78 
 
 
369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.66 
 
 
323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
324 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.17 
 
 
324 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
325 aa  165  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1039  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.43 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1211  alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>