More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2252 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
327 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2497  alcohol dehydrogenase  51.69 
 
 
368 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0063447  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5329  alcohol dehydrogenase  48.15 
 
 
322 aa  299  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.780994 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4143  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 
322 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00967604  normal  0.0463972 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3671  alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 
322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.44 
 
 
321 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.2 
 
 
315 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  46.13 
 
 
319 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  43.83 
 
 
323 aa  259  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1039  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.06 
 
 
321 aa  258  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  45.51 
 
 
319 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.73 
 
 
325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 
322 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  45.68 
 
 
323 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.06 
 
 
321 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  44.72 
 
 
322 aa  245  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0322  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.34 
 
 
331 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1221  putative quinone oxidoreductase  44.34 
 
 
331 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.908544  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0935  putative quinone oxidoreductase  44.34 
 
 
331 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.21 
 
 
323 aa  245  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.03 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1920  putative quinone oxidoreductase  44.75 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1683  quinone oxidoreductase, putative  44.75 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0232  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.75 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2197  putative quinone oxidoreductase  44.75 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  42.68 
 
 
327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.11 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
323 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
325 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.56 
 
 
322 aa  235  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.72 
 
 
326 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.67 
 
 
323 aa  235  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.94 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.18 
 
 
323 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.92 
 
 
324 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.28 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.63 
 
 
320 aa  232  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3409  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.07 
 
 
333 aa  232  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149484  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  38.89 
 
 
324 aa  231  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.11 
 
 
326 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.36 
 
 
326 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.54 
 
 
327 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  40.25 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  42.28 
 
 
325 aa  226  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
326 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 
321 aa  225  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
324 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  39.14 
 
 
324 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  41.23 
 
 
324 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.36 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0480145  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.49 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  39.09 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  41.12 
 
 
327 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 
325 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1928  alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00329815  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  41.12 
 
 
327 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  41.12 
 
 
327 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  41.12 
 
 
327 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  41.12 
 
 
327 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  41.12 
 
 
327 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.94 
 
 
324 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 
326 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.77 
 
 
328 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.63 
 
 
320 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.96 
 
 
324 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 
321 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 
325 aa  217  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  39.08 
 
 
324 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
328 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.24 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  37.92 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 
327 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.99 
 
 
324 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
322 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 
324 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
326 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  39.32 
 
 
324 aa  215  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
324 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.49 
 
 
322 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 
326 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.23 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.89 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  37.42 
 
 
329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.42 
 
 
329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  38.27 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.23 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  37.42 
 
 
329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.81 
 
 
315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  39.01 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  39.01 
 
 
324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  39.01 
 
 
324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1766  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.94 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0377504  normal  0.772625 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.01 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  39.01 
 
 
324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.01 
 
 
324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  39.01 
 
 
324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>