More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20440 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  100 
 
 
327 aa  638    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
326 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.76 
 
 
322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.02 
 
 
322 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
322 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.59 
 
 
330 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.21 
 
 
330 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  32.44 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  32.44 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.82 
 
 
331 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 
330 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.33 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.06 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  32.44 
 
 
330 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
326 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
326 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.38 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
325 aa  114  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1909  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
309 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  28.69 
 
 
325 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
325 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  28.27 
 
 
325 aa  102  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.43 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  25.94 
 
 
342 aa  95.9  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.05 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  26.75 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0501  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35 
 
 
332 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.63 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001036  hypothetical protein  27.57 
 
 
330 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  29.87 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0316  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.38 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.81 
 
 
327 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.11 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  27.08 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1211  alcohol dehydrogenase  33.18 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  26.38 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  26.96 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.46 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  28.86 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0757  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1238  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.45 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.1 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2788  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.67 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147926  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.45 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.51 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  26.12 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.58 
 
 
325 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.07 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03606  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
196 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.95 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.9 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  26.12 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.39 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.57 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  26.18 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  26.41 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.11 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  28.4 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.77 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2218  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.17 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  29.9 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.45 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  31.16 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.22 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.72 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.07 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  25.6 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  26.28 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.85 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.97 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.42 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  25.6 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  29.09 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.43 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0385  quinone oxidoreductase  26.27 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.930589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1928  alcohol dehydrogenase  25.34 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00329815  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  29.45 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.03 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.44 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.79 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  28 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.2 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>