More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1916 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  100 
 
 
326 aa  673    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.37 
 
 
322 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.72 
 
 
322 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
322 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 
330 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.1 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.1 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.1 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.41 
 
 
330 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  32.1 
 
 
330 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.18 
 
 
324 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  32.2 
 
 
330 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  32.49 
 
 
323 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  32.26 
 
 
327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
326 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001036  hypothetical protein  30.25 
 
 
330 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
326 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  25.45 
 
 
327 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.62 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  27.88 
 
 
325 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  26.76 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1909  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  29.26 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  27.74 
 
 
342 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.62 
 
 
333 aa  107  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.32 
 
 
344 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.23 
 
 
331 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.84 
 
 
324 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.03 
 
 
323 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.5 
 
 
329 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 
325 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  25.97 
 
 
325 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.75 
 
 
348 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.16 
 
 
338 aa  96.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  25.76 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.76 
 
 
329 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  25.87 
 
 
324 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.59 
 
 
329 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.4 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.56 
 
 
332 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  25.41 
 
 
324 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.6 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  25.4 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  24.32 
 
 
329 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 
322 aa  89.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.75 
 
 
324 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  22.42 
 
 
329 aa  89.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0630  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.3 
 
 
324 aa  89  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  22.39 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.32 
 
 
329 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  24.85 
 
 
321 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  24.32 
 
 
329 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.33 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  24.62 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  25.16 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.17 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6194  alcohol dehydrogenase  22.68 
 
 
322 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.32 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.08 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  25.98 
 
 
324 aa  86.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 
316 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  24.47 
 
 
327 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  23.8 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.92 
 
 
321 aa  85.9  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  23.84 
 
 
325 aa  85.9  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  22.83 
 
 
5802 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  24 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.8 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0316  alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.08 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386855  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  22.01 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.39 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3606  quinone oxidoreductase  23.51 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  23.78 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.01 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.85 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.99 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  22.96 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.16 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.02 
 
 
323 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  23.8 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  23.67 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2309  alcohol dehydrogenase  22.98 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463879  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  23.86 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0385  quinone oxidoreductase  27.49 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.930589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.61 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  26.06 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  23.62 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  24.1 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  25.74 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  24.41 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  20.82 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.78 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.97 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  22.48 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.04 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>