More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2309 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2309  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 324 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3606  quinone oxidoreductase  91.36 
 
 		 324 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2822  alcohol dehydrogenase  81.11 
 
 		 324 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.073881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29460  putative quinone oxidoreductase  69.57 
 
 		 324 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5626  alcohol dehydrogenase  70.19 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.20358  normal  0.110388 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6167  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.59 
 
 		 323 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224463  normal  0.398183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.34 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  45.2 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  44.72 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 		 329 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.72 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.79 
 
 		 324 aa  255  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.75 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.06 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  41.93 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  43.48 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.86 
 
 		 324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  43.75 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  41.93 
 
 		 324 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  41.61 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 		 327 aa  249  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.61 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.3 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.17 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.3 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  41.3 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.03 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  41.3 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  41.3 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  41.3 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  41.3 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.3 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  43.96 
 
 		 325 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  43.4 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.17 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.52 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 		 323 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.71 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3840  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.48 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  43.79 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.71 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  41.61 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  41.61 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  43.52 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.34 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  43.03 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  40.87 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.93 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.68 
 
 		 323 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.99 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  40.56 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.82 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  42.45 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.72 
 
 		 325 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  41.61 
 
 		 324 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4628  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  42.49 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  41.98 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  42.11 
 
 		 325 aa  235  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  40.25 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  42.95 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  44.97 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.27 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  41.61 
 
 		 327 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  41.61 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  41.61 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  41.61 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  41.61 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0255  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.38 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.263787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  41.61 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  40.25 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2009  alcohol dehydrogenase  42.24 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  40.51 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.49 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.08 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.87 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.08 
 
 		 327 aa  228  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.08 
 
 		 327 aa  228  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.08 
 
 		 327 aa  228  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  43.48 
 
 		 324 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.08 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3856  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  40.31 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.323591  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  40 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3766  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  40.31 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>