More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29460 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_29460  putative quinone oxidoreductase  100 
 
 
324 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2309  alcohol dehydrogenase  69.57 
 
 
324 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463879  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5626  alcohol dehydrogenase  71.65 
 
 
326 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.20358  normal  0.110388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3606  quinone oxidoreductase  68.63 
 
 
324 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2822  alcohol dehydrogenase  69.57 
 
 
324 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.073881  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6167  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.1 
 
 
323 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224463  normal  0.398183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  50.77 
 
 
325 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.69 
 
 
331 aa  292  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  46.3 
 
 
324 aa  288  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  48.61 
 
 
324 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.84 
 
 
325 aa  282  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  48.3 
 
 
329 aa  281  7.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.6 
 
 
324 aa  281  8.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.91 
 
 
324 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  47.37 
 
 
325 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.91 
 
 
324 aa  279  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  47.66 
 
 
327 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.75 
 
 
324 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  45.06 
 
 
324 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.75 
 
 
324 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.75 
 
 
324 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  44.75 
 
 
324 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  44.75 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  44.75 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.75 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  47.69 
 
 
325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  44.75 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  44.75 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  47.69 
 
 
325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45 
 
 
326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  47.38 
 
 
325 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  45.06 
 
 
324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.69 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  44.44 
 
 
324 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
324 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 
327 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  46.77 
 
 
325 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
324 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
324 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  43.52 
 
 
324 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.79 
 
 
327 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.06 
 
 
323 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.52 
 
 
323 aa  269  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
324 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
324 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  45.51 
 
 
327 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  45.51 
 
 
327 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  45.51 
 
 
327 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  45.51 
 
 
327 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  45.51 
 
 
327 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  45.51 
 
 
327 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  46.46 
 
 
325 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.85 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  47.08 
 
 
325 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.54 
 
 
325 aa  265  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.69 
 
 
326 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.11 
 
 
323 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  44.62 
 
 
326 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 
322 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  45.79 
 
 
323 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  44.92 
 
 
325 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.9 
 
 
327 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.54 
 
 
326 aa  261  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 
326 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.69 
 
 
326 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  49.38 
 
 
319 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 
326 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  44.62 
 
 
325 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.48 
 
 
323 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.56 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.95 
 
 
327 aa  258  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.25 
 
 
322 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 
325 aa  258  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0255  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  43.9 
 
 
327 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.263787  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.95 
 
 
328 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  45.37 
 
 
323 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.31 
 
 
325 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.31 
 
 
324 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 
325 aa  255  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  44.62 
 
 
326 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0173  quinone oxidoreductase  44.31 
 
 
325 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.62 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  46.39 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  43.29 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  44.92 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.71 
 
 
321 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3856  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  43.6 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.323591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  42.06 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3766  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  43.6 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252302  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.51 
 
 
327 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.51 
 
 
327 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  42.99 
 
 
327 aa  252  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  42.99 
 
 
327 aa  252  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  42.99 
 
 
327 aa  252  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.51 
 
 
327 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  42.99 
 
 
327 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  42.99 
 
 
327 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03883  hypothetical protein  42.99 
 
 
327 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>