More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0316 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0316  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 321 aa  613  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  36.79 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.55 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.18 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  27.52 
 
 		 325 aa  110  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.08 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  28.23 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.89 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.23 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  28.03 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  27.89 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.99 
 
 		 331 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  27.21 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.95 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  28.42 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.18 
 
 		 333 aa  99.8  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.21 
 
 		 331 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  27.21 
 
 		 331 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.18 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.63 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.12 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.22 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  34.73 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.66 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4811  predicted protein  34.85 
 
 		 245 aa  86.3  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238831 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  26.03 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45262  predicted protein  28.42 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235786  normal  0.755284 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  24.75 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.2 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34892  mitochondrial trans-2-enoyl-CoA reductase 2  25.64 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53084  mitochondrial 2-enoyl thioester reductase  28.06 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.752988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001036  hypothetical protein  25.25 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.34 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  25.97 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.62 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.92 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  26.92 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.5 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.17 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10497  predicted protein  27.34 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  28.39 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.62 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  27.93 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.45 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  28.37 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.62 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  27.91 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3042  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.77 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  25.31 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.4 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2009  alcohol dehydrogenase  27.83 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  28.37 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3606  quinone oxidoreductase  29.45 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  22.98 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.97 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  29.43 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  27.44 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2309  alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.78 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  27.34 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  30.84 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  28.52 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.92 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.78 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  23.78 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1920  putative quinone oxidoreductase  30.84 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1683  quinone oxidoreductase, putative  30.84 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  25.25 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  23.78 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1221  putative quinone oxidoreductase  30.84 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.908544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0322  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.84 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0232  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.84 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0935  putative quinone oxidoreductase  30.84 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2197  putative quinone oxidoreductase  30.84 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3409  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.21 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  29.28 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.13 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  27.39 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.77 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  28.29 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.84 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  23.21 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.24 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.1 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.87 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.97 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>